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多种测序技术文献资料
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多种测序技术在药品检测环境微生物鉴定分析中的应用
目的 :通过本次研究工作,探讨多种测序技术在药品检测环境微生物鉴定分析中的应用,为制药行业的环境微生物污染控制和查找源头提供技术层面的支持.方法 :从微生物实验室环境中连续12个月采样收集获得本10株细菌和11株霉菌,并对收集的菌株采用生化鉴定、一代测序技术和宏基因组测序仪器进行分析鉴定,相互验证菌株鉴定结果的准确性.结果 :10株细菌的一代测序鉴定与生化鉴定比较,属水平分类一致的有4株,种水平分类一致的有4株.采用宏基因组对各菌株进行全基因组测序鉴定,共获得了10株菌的信息,与一代测序比较,种水平一致的有5株,属水平一致的有5株,多了5株菌的信息.霉菌生化鉴定获得5株菌信息,一代测序获得了4株菌信息,与生化鉴定结果相比,缺失了1株菌的信息;宏基因组测序结果包含8属和11种,8属覆盖了霉菌生化鉴定结果中的5株菌和一代测序的4株菌的信息,种水平全部覆盖.结论 :宏基因组测序能实现对菌株种属信息的准确区分、鉴定;常规生化可鉴定特异性种属的菌株,但对种属特异性不高的菌株鉴定尚显不足;一代测序可实现菌株的基因测序,但对种属的特异性区分低于生化鉴定.
