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树鼩粪便细菌分离培养与鉴定
目的：了解人工饲养树鼩粪便菌群多样性，为树鼩的正常饲养繁殖和微生物质量控制标准化提供依据。方法随机采集10份树鼩粪便样品，利用有氧及厌氧培养基进行细菌分离培养，提取细菌基因组DNA后PCR扩增16SrRNA基因并测序鉴定。结果本实验从树鼩粪便样品中，经有氧培养分离鉴定出25株、12种细菌，经厌氧培养分离鉴定出25株、10种细菌，包括变形杆菌属、肠球菌属、埃希菌属、志贺菌属、葡萄球菌属、气单胞菌属、拉恩氏菌属、拉乌尔菌属、微小杆菌属、链球菌属、明串珠菌属。结论树鼩肠道好氧菌及厌氧菌具有丰富的种属多样性，普通变形杆菌群、费格森埃希菌群和屎肠球菌群可能是树鼩肠道的主要寄生菌群。
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QIAamp及Biomed粪便细菌基因组DNA提取试剂盒提取人肠道细菌基因组DNA质量的差异
背景:有研究表明,不同试剂盒提取的粪便细菌基因组DNA 质量有差别,选择一种操作简便、质量优良的粪便细菌基因组DNA 提取试剂盒成为研究者们关注和急需解决的问题.目的:比较QIAamp 及Biomed 粪便细菌基因组DNA 提取试剂盒提取的人肠道细菌基因组DNA 质量的差异.方法:收集健康成年人新鲜粪便标本30 例,用两种试剂盒分别提取细菌基因组DNA,检测其浓度、吸光度A260/280 nm 值及提取率,设计乳酸菌属16S rDNA 基因特异性引物,以各自所提DNA 为模板,进行常规聚合酶链反应,凝胶电泳后比较条带数量、明暗度及密度,并进行实时荧光定量聚合酶链反应定量检测各自所含乳酸菌属的数量.结果与结论:QIAamp 试剂盒提取的正常人肠道细菌基因组DNA 的浓度、提取率、表达量及乳酸菌属的数量均高于Biomed试剂盒(P < 0.05 或P < 0.01).说明QIAamp 试剂盒提取的粪便细菌基因组DNA 质量优于Biomed 试剂盒.
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介绍一种改量的粪便细菌基因组DNA提取试验方法
目的 观察改变细菌裂解温度对提取粪便细菌基因组DNA量和纯度的影响.方法 收集10例肝硬化患者粪便,每例患者粪便等分成两份,再随机分成两组.采用QIAamp DNA Stool Mini Kit试剂盒(国际通用粪便细菌基因组DNA提取试剂盒)进行抽提,一组(A组)按照试剂盒说明书温度要求进行粪便细菌基因组DNA提取,一组(B组)对试剂盒细菌裂解温度改良后再进行提取.结果 与按照试剂盒说明书温度进行提取组相比,改变细菌裂解温度后粪便基因组DNA提取量明显增高(P<0.05),而粪便基因组DNA提取纯度(OD260/280、OD260/230)无明显变化(P>0.05).结论 改变细菌裂解温度能明显提高粪便细菌基因组DNA提取量,而不改变粪便细菌基因组DNA的提取纯度.该方法可以解决因粪便采样量少导致粪便基因组DNA提取量不足的问题.
