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  • 砷化物对人类金属硫蛋白-3cDNA基因表达的影响

    作者:潘泽民;杨磊;刘开泰;顾永清;王国荃;应康;谢毅

    目的探讨砷化物对人类正常肝细胞金属硫蛋白(Metallothionein,MT)-3 cDNA基因表达的影响.方法利用SMART方法克隆cDNA基因,生物信息学分析克隆基因的同源性、染色体定位、基因结构和对该基因编码蛋白质进行分析并对该蛋白质进行跨膜信息分析,基因芯片方法检测染砷L-02细胞MT-3基因的表达.结果成功克隆MT-3 cDNA基因,经生物信息学分析可知,该基因定位在人16号染色体16q13区段,跨膜信息分析发现MT-3基因编码蛋白质可以穿出生物膜,基因芯片结果证实染砷的人正常肝L-02细胞在染砷早期MT-3基因表达增高.结论该研究发现人类MT-3基因是砷化物作用的一个相关基因,早期参与了砷代谢解毒.

  • 大肠癌转移相关基因FMNL2的生物信息学分析

    作者:李余发;肖法嫚;梁莉;丁彦青;余力

    目的:研究各转移能力不同细胞系中的基因表达差异.方法:各转移能力不同的细胞系SW480、SW620、SW480/M5标本的mRNA与表达谱芯片杂交,获得表达差异基因.用生物信息学方法对基因FMNL2进行初步分析,以及用荧光定量PCR检测了转移能力不同的细胞系SW480、SW620、SW480/M5中FMNL2的表达.结果:表达谱芯片共找出了422条差异表达基因.用生物信息学方法分析了表达上调的基因FMNL2的结构、染色体定位、编码蛋白质的理化性质、亚细胞定位等信息.对FMNL2蛋白的多物种相似蛋白进行了系统进化分析,基本明确了该基因编码一种在胚胎和肿瘤细胞中高表达、进化中保守的核蛋白,以及证实了该基因在转移能力高的SW620和SW480/M5中比SW480中要高.结论:生物信息学分析表明,FMNL2是一个有研究价值的癌相关蛋白.这个蛋白可能参与正常的胚胎发育,但也与肿瘤转移能力有一定的关系.

  • 介绍cDNA基因和差异表达基因的克隆技术

    作者:何玲;赵卉;于娜;潘泽民

    cDNA文库的构建是克隆cDNA基因重要的方法,方法的发展经历了置换合成法、SMART方法、固相cDNA文库的构建和逆转录病毒cDNA表达系统构建.细胞内分布克隆方法用于克隆功能性基因.而差异表达基因克隆方法用于克隆不同生命状态下表达基因.

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