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2-C-甲基-D-赤藓糖-4-磷酸胞苷转移酶文献资料
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胡黄连2-C-甲基-D-赤藓糖-4-磷酸胞苷转移酶基因的生物信息学分析
目的 研究胡黄连Picrorhiza kurrooa 2-C-甲基-D-赤藓糖-4-磷酸胞苷转移酶(MCT)基因特征并预测MCT结构与功能位点.方法 以胡黄连MCT基因为研究对象,利用NCBI网站及生物信息学软件对其碱基分布、氨基酸组成、亲疏水性、保守区及二级结构和三级结构进行预测和分析;并对9个物种的MCT基因进行多重比对与进化分析.结果 胡黄连MCT基因的mRNA序列长为l 216 bp (GenBank JQ991625.1),编码由399个氨基酸组成的蛋白质,该蛋白质相对分子质量为44 448.5,其中量高的为Ser(10.0％);整个多肽中疏水性氨基酸占59.5％,平均疏水值为0.050;与丹参Salvia miltiorrhizaMCT氨基酸序列对比同源性高,达99％.结论 胡黄连MCT基因处于稳定状态,编码的蛋白为疏水性蛋白,在进化过程中是相对保守的,获得的保守区段序列信息为其他物种MCT基因的克隆奠定了基础.
