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利用TCGA数据库分析Glypican-6在鼻咽癌中的表达及意义

倪茂美;杨秀海;刘蕾;聂敏;付珮一;刘世喜

摘要: 目的 探索glypican-6基因在鼻咽癌中的表达水平,预测glypican-6参与鼻咽癌发生发展的关系.方法 从癌症基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)提取头颈癌glypican-6的数据进行整合;有临床样本信息的成对(癌和癌旁)RNA-seq数据,通过edgeR分析软件完成分析工作.结果 glypican-6在鼻咽癌组织中的表达水平较癌旁组织显著上调.结论 Glypican-6可作为促癌基因在鼻咽癌中发挥作用,有望成为鼻咽癌的预后指标或者治疗靶点.

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