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鼻病毒A22型文献资料
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一株鼻病毒A22型的分离鉴定及其VP1基因遗传特征分析
目的 分析2011年昆明市手足口病患儿粪便中分离获得的人鼻病毒(human rhinovirus,HRV)A22型分离株KM4/2011全长VP1基因的遗传特征.方法 采用KMB17细胞对手足口病患儿粪便样本中筛查出的1株HRV样品进行病毒分离,应用RT-PCR法扩增病毒VP1基因,并进行测序,采用BLAST软件对所测定的节段序列进行数据库比对;采用Geneious basic 5.6.5软件进行核苷酸和氨基酸同源性比对;采用Mega 5.05软件将HRV A22及部分HRV A、B和C群全长VP1基因构建系统进化树.结果 分离株为KM4/2011,经扩增、测序和序列拼接获得长度为867 bp的VP1基因;KM4/2011株与其他HRV分离株核苷酸和氨基酸的同源性分别为48.1％ ～ 91.0％和38.2％ ～97.6％,其中与HRV A22分离株的核苷酸和氨基酸同源性较高,分别为90.8％ ～ 91.0％和97.3％ ～ 97.6％;基因进化树分析显示,KM4/201l株与HRV A22基因型属于同一个进化分枝.结论 KM4/2011分离株为HRV A22型,存在地域差异.
