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  • 线性B细胞表位预测的生物信息学资源和工具的研究进展

    作者:刘洪波

    B细胞表位鉴定是表位疫苗、免疫诊断试剂和治疗抗体研发的关键.表位的实验鉴定方法成本高,且费时费力;生物信息学方法为B细胞表位的筛选鉴定提供了一条经济、快速的技术路线.近10年来,线性B细胞表位预测的计算方法及相关数据库得到较快发展,但总体预测表现尚不能令人十分满意.本文就线性B细胞表位预测的生物信息学资源和工具的新进展作一综述,并指出该领域当前存在的主要问题以及未来改进和发展的方向.

  • 烟曲霉Aspf3和Aspf4线性B细胞抗原表位小基序鉴定

    作者:石晶;高岩;霍克克;季朝能;唐海平;徐万祥;谢毅;顾少华

    烟曲霉(Aspergillus fumigatus)是一种广泛存在于自然界中的条件致病菌,其产生的分生孢子被易感人群吸入后定植于肺部,引起3种曲霉病:致咯血的曲霉肿、致肺纤维化的变应性支气管肺曲霉病、致较高死亡率的侵袭性曲霉病。目前临床上用于诊断烟曲霉感染的血清免疫学指标有半乳甘露聚糖和1,3‐β‐D‐葡聚糖,但特异度和灵敏度方面存在一定的局限性。Asp f3和Asp f4为烟曲霉主要抗原,在感染者血清中存在相应的循环抗体。本研究分别用兔抗Asp f3和Asp f4抗血清对其进行抗原表位扫描,鉴定了8个Asp f3和6个Asp f4小表位基序肽。用所鉴定的小表位基序与烟曲霉其他抗原的小表位基序构建嵌合肽,可能有助于提高烟曲霉感染诊断的特异度和灵敏度。

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