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  • 亲缘群体单体型推断的研究进展

    作者:胡艳玲;蒋越;王起山;潘玉春

    随着高通量的基因分型技术的出现,越来越多的单核苷酸多态性( single nucleotide polymorphism,SNP)可被检测。基因组研究中,单体型分析已被运用到SNP位点与复杂性状的关联分析中。现有的单体型推断方法包括基于非亲缘群体的方法,DNA pool样本方法和系谱资料方法。不过家庭及亲缘数据可为单体型推断提供很重要的信息,利用这些信息进行单体型推断会增加准确性。如今对亲缘群体单体型推断的算法和软件已有很多报道。该文的目的是回顾这些算法、软件以及它们的优缺点和适用的群体类型,同时探讨仍然存在的问题和面临的挑战。

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