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改进型扩增前引物延伸反应文献资料
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两种全基因组扩增方法用于微量检材STR基因座分型比较
目的 应用多重置换扩增(MDA)技术和改进型扩增前引物延伸(IPEP)技术对法医学微量DNA进行全基因组扩增,比较两种方法的STR分型效果及法医学应用价值.方法 用MDA、IPEP方法分别对不同模板量DNA进行扩增,扩增产物用实时荧光定量PCR技术定量、用AmpFLSTR Identifiler(R)试剂盒检测基因型.结果 MDA方法可对模板DNA增加103～106倍,IPEP方法可增加25～310倍.为获得完整准确的分型结果,MDA低需1 ng基因组DNA,IPEP低需0.05 ng基因组DNA.当基因组DNA为0.01 ng～0.1 ng时,IPEP产物、MDA产物的平均基因座检出数均高于未经全基因组扩增的DNA,其中IPEP产物的平均基因座检出数高于MDA产物.结论 MDA方法、IPEP方法均可提高微量检材的STR分型效果.MDA方法的产量高于IPEP方法;IPEP方法的灵敏度高于MDA方法,且对微量DNA的STR分型效果优于MDA方法,因此更适于法医学痕量DNA检测.
关键词： 多重置换扩增反应 改进型扩增前引物延伸反应 全基因组扩增 STR分型
