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提取陈旧阳性血膜疟原虫DNA方法的研究
目的:建立一种能够提取陈旧阳性血膜疟原虫 DNA 的方法,为疟原虫基因溯源研究奠定基础。方法应用 DNA 抽提试剂盒( QIAamp DNA Mini Kit )改良后提取41份吉氏染色镜检阳性血膜的疟原虫 DNA ,并与 Chelex-100和 Na2HPO4法进行比较。巢式 PCR 扩增疟原虫 SSU rRNA 基因片段,鉴定疟原虫虫种。 PCR 结果进行测序和序列比对,统计分析20世纪80年代与近10年血膜、不同血膜处理方法以及不同质量血膜的 PCR 阳性检出率差异。结果改良试剂盒法 PCR 结果总阳性检出率为70.7%(29/41)。80年代和近10年血膜 PCR 阳性检出率分别为78.6%(11/14)和66.7%(18/27),两组间差异无统计学意义(χ2=0.63, P>0.05)。经去油、脱色处理和未经处理组血膜的 PCR 阳性检出率分别为62.5%(15/24)和82.4%(14/17),两组间差异无统计学意义(χ2=1.89, P>0.05)。质量较好和较差血膜的 PCR 阳性检出率分别为93.3%(28/30)和9.1%(1/11),两组间差异有统计学意义(χ2=27.59, P<0.01)。测序结果表明扩增目的片段与预期结果一致。 Chelex-100和 Na2HPO4法PCR 未能扩增出特异性目的条带。结论试剂盒( QIAamp DNA Mini Kit )改良法提取80年代血膜疟原虫DNA 可获得较高PCR 阳性检出率,且染色剂和镜检油渍对血膜疟原虫 DNA 提取效果无明显影响。