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我国内脏利什曼病山丘疫区与平原疫区利什曼原虫SSU rDNA多变区序列分析
[目的]分析我国内脏利什曼病(VL)山丘疫区与平原疫区利什曼原虫(L.d)分离株小亚基核糖体DNA(SSU rDNA)多变区的序列差异.[方法]nDNA进行PCR扩增,将扩增出的SSU rDNA基因的特异片段克隆于pGEMR-T Easy Vector上,采用通用引物M13进行PCR扩增,全自动测序仪测序.[结果]序列分析显示,扩增的5株利什曼原虫SSU rDNA序列大小均为392 bp;序列差异均发生在两个独特序列区(UQ-I和UQ-Ⅱ);山丘疫区L.d甘肃分离株和四川分离株均在UQ-Ⅱ区上有2个相同的碱基突变,L.d甘肃分离株UQ-I区上有1个碱基突变;无移码突变.[结论]山丘疫区分离株与平原疫区分离株之间的碱基序列有差异,平原疫区L.d山东分离株与婴儿利什曼原虫(L.in fantum)的碱基序列相同.
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利什曼原虫中国分离株SSU rDNA多变区序列分析
目的分析我国荒漠、山丘疫区利什曼原虫分离株的 SSU rDNA多变区序列差异。方法 nDNA进行PCR扩增,将扩增出的SSU rDNA基因的特异片段克隆于pGEMR-T Easy Vector上,采用通用引物M13进行PCR扩增,全自动测序仪测序。结果序列分析显示本文报道的荒漠、山丘疫区的2株利什曼原虫(L.d.XJ771、L.d.SC6)的SSU rDNA序列大小均为392bp;序列差异发生在两个独特序列区(UQ-Ⅰ和UQ-Ⅱ),无移码突变;与GeneBank中的利什曼原虫比较分析,同源性在98%以上。结论我国荒漠、山丘疫区利什曼原虫分离株之间的SSU rDNA多变区的碱基序列有差异;荒漠疫区分离株L.d.XJ771与国际标准株L.d. DD8的SSU rDNA多变区的碱基序列完全相同。