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转移性喉鳞状细胞癌组织中长链非编码RNA的筛选及鉴定
目的:应用高通量基因芯片技术进行转移性喉鳞状细胞癌(laryngeal squamous cell carcinoma,LSCC)中差异表达长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA)的筛选及鉴定,寻找有价值的LSCC相关候选基因和分子标志物.方法:4例LSCC组织标本均来自河北医科大学耳鼻咽喉头颈外科生物样本库,病理证实为淋巴结转移的LSCC组织及癌旁黏膜组织.提取标本组织总RNA后,应用SBC-lncRNA基因芯片检测差异表达的lncRNA及mRNA,采用差异倍数以及Student'st法对差异表达基因进行筛选,将差异倍数(linear)≤ 0.5或者≥2.0和P＜ 0.05判断为差异表达基因.选取特定的差异表达lncRNA,应用qRT-PCR技术验证芯片结果的可靠性.结果:通过对转移性LSCC组织和癌旁组织的lncRNA表达谱分析显示,转移性LSCC组织与癌旁组织的lncRNA表达谱存在明显差异,差异表达的lncRNA3 073个,其中癌组织中表达上调1 967个、下调1 106个;差异表达的mRNA2 809个,其中癌组织中表达上调1 791个、下调1 018个.差异表达的lncRNA主要参与细胞增殖、凋亡及免疫应答等生物学过程,涉及细胞因子及其受体的相互作用、趋化因子信号通路、细胞周期调节、P53信号通路等.选取其中10条具有显著差异表达的lncRNA,在25例LSCC标本组织中进行qRT-PCR验证,发现表达趋势与芯片检测结果一致.结论:转移性LSCC组织及癌旁组织的lncRNA表达谱存在明显差异,深入分析这些差异表达lncRNA的分子作用机制对阐明转移性LSCC的侵袭转移机制有重要的意义,可为LSCC特异性肿瘤标志物的筛选及有效的靶向治疗提供实验依据.
