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胸腺嘧啶合成文献资料
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SHMT1基因启动子的rs638416位点与先天性心脏病的相关性
目的 通过研究丝氨酸羟甲基转移酶(serine hydroxy methyl transferase,SHMT1)基因启动子区的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)来探讨该基因与先天性心脏病(congenital heart disease,CHD)的相关性.方法 选取来自山东省的201例CHD患儿(病例组)和192例正常儿童(对照组),采用Sanger测序法对rs638416和rs117940726两个位点的基因分型进行病例-对照研究,进一步用双荧光素酶报告基因分析其是否为功能性SNP.结果 两个SNP位点的基因型分布在病例组和对照组中均符合Hardy-Weinberg平衡;单位点分析显示rs638416位点G等位基因在病例组中分布频率显著高于对照组(P=0.009).经非条件Logistic回归分析确定,Log-additive模型适用于分析rs638416,且该模型下统计学差异显著(OR=1.49,95％CI:1.11～2.01,P=0.007 4);双荧光素酶报告基因分析显示带有G等位基因的启动子序列转录效率较带有C等位基因的启动子序列低36％ (P=0.013).结论 rs638416位点能影响SHMT1转录效率,并与心脏发育异常相关,提示rs638416位点G等位基因是山东人群CHD发生的溃传风险因子.
