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同源筛选文献资料
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编码蛋白激酶的人类新基因NEK8的电子克隆
目的:克隆人类基因组中小鼠NEK8基因的同源物.方法:用同源筛选策略,以小鼠NEK8基因作为信息探针,在GenBank数据库中进行TBLASTN分析,将获得的高度同源的EST用VECTOR NTⅠ软件拼接成重叠群.利用BLAT分析确定NEK8基因的基因组结构以及染色体定位.利用SMART网上分析工具进行结构域预测,利用Unigene数据库进行表达谱分析.结果:电子克隆到人类NEK8新基因cDNA序列,长度为2858bp,含完整的ORF,编码一条692个氨基酸的多肽,被预测的分子量为74.8KDa,等电点8.04.定位在染色体17q11.2, 由15个外显子和14个内含子组成.其编码蛋白含有一个苏氨酸/丝氨酸蛋白激酶结构域,与NEK家族成员有较高的同源性.电子表达谱分析显示NEK8基因在胎盘,胃,结肠,眼,胰腺,骨骼,肾,子宫等组织中表达.结论:电子克隆到编码苏氨酸/丝氨酸蛋白激酶的人类新基因NEK8.
