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AsfD文献资料
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伤寒沙门菌非编码RNA AsfD的分子鉴定及表达特性
目的:对伤寒沙门菌flhDC基因对侧编码的疑似非编码RNA AsfD进行分子鉴定及表达特性分析.方法:在AsfD已知序列区设计特异性引物,体外转录制备RNA探针,通过RNA印迹检测伤寒沙门菌AsfD的表达;使用cDNA末端快速扩增(5'rapid amplification of cDNA ends,RACE)和RT-PCR分析AsfD的转录起始位点和终止区域;用qRT-PCR检测AsfD在伤寒沙门菌不同生长时相和环境应激下的表达特性.结果:RNA印迹结果表明,伤寒沙门菌中确实存在AsfD表达,长度在2300 nt左右;5'RACE分析表明,AsfD转录起始点位于flhC基因终止密码子下游590 bp;RT-PCR结果表明其转录终止区域位于flhD基因起始密码子上游558~788 bp之间;序列分析显示AsfD全区域没有明显的ORF结构;qRT-PCR结果显示,AsfD在伤寒沙门菌生长的稳态期表达较高,酸、氧和高渗环境应激后均明显下降(P<0.01).结论:AsfD为伤寒沙门菌一长链非编码RNA,在不同时相和应激条件下存在表达调节.
