首页 > 文献资料
-
精子相关抗原9 B细胞及T细胞表位富集区预测
目的:预测人精子相关抗原9(SPAG-9)的表位富集区.方法:以SPAG-9的全长序列为基础,利用生物信息学软件,采用Hopp&Woods的亲水性方案、Zimmerman极性参数和Jameson-Wolf抗原指数方案和Emini表面可及性方案,并结合SPAG-9的二级结构与其柔性区域及跨膜区域对SPAG-9的优势B表位进行综合分析,进一步运用抗原指数分析预测SPAG-9的B细胞表位.同时,分别应用SYFPEITHI、NetCTL以及IEDB预测HLA-A2、HLA-A24限制的CTL表位.后,综合B细胞表位和CTL表位,预测SPAG-9的表位富集区.结果:经综合分析,SPAG-9的B细胞优势表位可能存在于N端的197-201,236-243,249-253,291-299,306-312,324-327,332-337,348-352,488-494,539-542,546-550,565-573,699-702,802-807,869-873,875-880,882-887,1173-1178,1195-1200区段.其HLA-A2限制的CTL表位肽为19-27,49-57,50-58,56-64,343-351,381-389,413-421,447-455,521-529,551-559,665-673,733-741,837-845,926-934,950-958,964-972,998-1006,1016-1024,1094-1102,1140-1148,1150-1158区段,HLA-A24限制的CTL表位肽为31-39,137-145, 517-525,943-951.综合B表位与CTL表位,SPAG-9的332-352与551-573区段,即SAENEEKSEVQAIIESTPELD、SIWQFFSRLFSSSSNTTKKPEPP肽段是SPAG-9的表位富集区.结论:利用生物信息学预测发现SPAG-9抗原的332-352与551-573为SPAG-9的表位富集区.
