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MCODE算法文献资料
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内质网应激在三氧化二砷抑制HL-60增殖过程中的效应机制
目的 探究三氧化二砷(ATO)引起内质网应激的效应机制,为掌控急性早幼粒白血病治疗药物监测提供间接药理学指标.方法 通过ATO的毒理学数据库关联基因数据整理建立蛋白-蛋白互作网络,使用MCODE算法对网络拓扑关系聚类分析寻找关联基因群;采用HL-60细胞模型进行实验研究.MTT法评价ATO对HL-60的细胞毒活性;Realtime PCR法检测细胞内质网应激相关基因表达变化;Westem blot检测内质网应激相关蛋白表达水平;用ER-Tracker Red对内质网进行特异性荧光染色;流式细胞技术检测细胞分化及凋亡指标变化.结果 ATO相关的206个基因PPI网络中有3 794对关系,排名前4的基因群中内质网应激模块凸显;ATO能抑制HL-60细胞增殖,并呈浓度依赖性;AT0在给药4h即可引起细胞内质网应激,GRP78和GRP94表达较明显,随着时间延长基因表达水平变化明显,1 ～4 μmol·L-1引起GRP78、GRP94和Nrf2表达,8μmol·L-1引起CHOP大量表达.ATO在1、2μmol·L-时引起eIF2α蛋白磷酸化水平增加,在8 μmol·L-1时诱导CHOP蛋白大量表达;内质网染色结果显示,4、8 μmol·L-1的ATO诱导内质网的肿胀;流式结果表明ATO在1μmol·L-1时引起细胞分化,在2 μmol·L-时出现明显分化群,4、8 μmol·L-1时细胞分化同样明显,但在8 μmol·L-1时细胞同时出现凋亡群.结论 ATO抑制HL-60细胞增殖过程中出现内质网应激,并呈浓度依赖性阶段性切换效应.
