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  • 华支睾吸虫多药物/代谢产物外排蛋白样基因的识别和生物信息学分析

    作者:胡旭初;赵宇;黄灿;刘玲;余新炳;徐劲

    目的 预测华支睾吸虫假想的多药物/代谢产物外排蛋白的结构及功能及其应用前景.方法 利用多种生物信息学分析软件,从华支睾吸虫全长cDNA质粒文库中识别出多药物/代谢产物外排蛋白样基因,分析蛋白的拓扑学结构、生物学和免疫学功能特征,根据结构与功能预测其应用前景.结果 该基因编码189个氨基酸;含有5段跨膜区,N端在胞内,C端在胞外,具有主要协助因子超家族的结构特征.与日本血吸虫同源蛋白(一致性为67%,相似性为80%)相比,该蛋白的4段跨膜区中含有保守的精氨酸和组氨酸残基.该蛋白含有多个磷酸化位点和T、B细胞表位,且线性B细胞表位均位于胞外区.结论 所克隆的华支睾吸虫基因可能编码一个小蛋白型阴离子多药物/代谢物外排蛋白;该蛋白可能定位于华支睾吸虫皮层表膜,是一个潜在的诊断和疫苗候选抗原和药物靶标分子.

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