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一种条件致病节杆菌的分离与鉴定
目的对一株分离自慢性皮肤病变的少见细菌进行鉴定.方法用表型性状、化学分类和16SrDNA测序鉴定并作药敏试验.结果为专性需氧具有杆-球循环的棒杆菌,在无机盐基础培养基上可利用单一有机化合物为碳源进行生长,其肽聚糖型为A3((Lys-Ser-Thr-Ala),其16SrDNA序列与氧化节杆菌和多色节杆菌极接近,同源性99%以上.结论此分离菌株属于节杆菌属中的氧化节杆菌群,并可能为一新种.
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中度和重度牙周炎患者龈下细菌多样性和群落结构分析
目的:通过16 S rDNA测序探索和比较重度牙周炎和中度牙周炎患者龈下细菌多样性及群落结构.方法:选取17例中度或重度牙周炎患者作为研究对象,根据症状将其分为重度牙周炎组9例与中度牙周炎组8例.收集提取其牙周袋内龈下细菌进行16S rDNA测序,然后对每个样品的可操作分类单元(operational taxonomy u-nit,OTU)丰度和每个水平的分类(域、界、门、纲、目、科、属、种)进行统计并进行α多样性与β多样性分析,后对每个样品的16S rDNA组成数据分析并预测细菌功能.结果:从龈下样本中获得的高质量的序列(555028)分为373个OTUs,代表303个独立的种,隶属于138属75科,47目,28类,12门.两组共332个OTUs,表明核心龈下微生物的存在.龈下微生物的优势菌门包括拟杆菌门、厚壁菌门、梭杆菌门、变形菌门和螺旋菌门,优势菌属包括梭形杆菌属、链球菌属、卟啉单胞菌属、普氏菌属、奈瑟氏菌属和密螺旋体属.α多样性分析结果表明,重度牙周炎患者的微生物多样性高于中度牙周炎组.β多样性分析表明两组微生物群落结构相似.所有样品中共预测到39种代谢功能,主要集中于膜转运(10.9％)、复制和修复(9.9％)、糖代谢(9.3％)、氨基酸代谢(9.1％)、翻译(6.9％)、能量代谢(5.8％)和不良性征(5.1％).结论:牙周炎患者龈下细菌具有丰富的多样性与稳定的群落结构,龈下细菌的功能与口腔其他部位的细菌相同.牙周炎疾病的严重程度与龈下细菌的多样性有关,但与细菌的群落结构尚未发现相关性.鉴于牙周炎的微生物多样性和共生性,调控微生物相互作用及其功能发挥的治疗策略应得到进一步发展.
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16SrDNA测序在细菌性重症肺炎痰液致病菌分析中的应用
目的 采用16S rDNA测序,分析重症肺炎痰液中致病菌构成,探索病原学诊断的新方法.方法 收集细菌性重症肺炎患者的痰液标本,运用聚合酶链反应(PCR)扩增及高通量测序技术,对标本中病原菌16SrDNA V3～V5区进行多样性分析.结果 测序显示痰液样本含有的物种种类相对较多,还存在较多未被测序检测到的物种,优势菌属主要为链球菌属、变性菌属、不动杆菌属、鞘氨醇单胞菌属、普氏菌属、克雷伯菌属、假单胞菌属、水杆菌属、棒状杆菌属等.结论 细菌性重症肺炎痰液致病菌种复杂多样,物种丰富,16S-rDNA测序是临床实践中一种新的尝试.
