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新基因AY358935对B16细胞小鼠体内外生长的影响
目的:探讨新基因AY358935对小鼠黑色素瘤B16在细胞小鼠体内外生长的影响及其可能的机制.方法:构建小鼠AY358935基因真核表达质粒并稳定转染B16细胞.MTT法检测AY358935转染细胞(B16-mAY细胞)、空质粒pcDNA3.1转染细胞(B16-pcDNA3.1细胞)及未转染的 B16细胞的体外增殖活性.将 B16-mAY及B16-pcDNA3.1细胞分别腹背皮下接种于C57小鼠,观察两组成瘤情况.MTT法检测B16-mAY细胞培养上清对人脐静脉内皮细胞(HUVEC)增殖的影响.结果:B16-mAY细胞的体外增殖活性明显高于B16-pcDNA3.1细胞及对照B16细胞(P<0.05).B16-mAY细胞移植瘤体积较B16-pcDNA3.1组明显增大(P<0.05).B16-mAY细胞培养上清组HUVEC增殖活性明显高于B16-pcDNA3.1培养上清组(P<0.05).结论:AY358935具有促进B16细胞生长的作用,其机制可能涉及促血管生长.
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新基因AY358935的生物信息学分析及功能预测
目的 对新基因AY358935的功能性质进行生物信息分析,为深入研究该基因功能奠定基础.方法 利用生物信息学分析软件,分析新基因AY358935及其编码蛋白的性质、定位、结构、表达谱等特征,并根据相关信息预测其生物学功能.利用Western blotting检测病毒感染早期AY358935的表达变化.结果 AY358935基因进化保守,与马、小鼠、斑马鱼、非洲爪蟾的相似性分别为74%、60%、38%、33%.亚细胞定位于线粒体的可能性大.含有一个N末端信号肽序列和单次跨膜结构,多个磷酸化位点,二级结构主要是α螺旋和无规则卷曲.在正常组织和癌组织表达广泛,并受双链RNA依赖蛋白激酶的表达调控.AY358935蛋白表达在水泡性口炎病毒感染2h后即明显上调.结论初步预测AY358935为具有重要功能的小分子分泌蛋白,可能参与细胞增殖和抗病毒天然免疫调控.
关键词： AY358935 生物信息学 分泌蛋白 双链RNA依赖蛋白激酶 水泡性口炎病毒
