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miRNA-126*靶基因预测及其相关信号通路的生物信息学分析
目的 通过对miRNA-126*进行靶基因预测及信号通路生物信息学分析,以期为miRNA-126*靶基因相关实验及其调控肺发育机制的深入研究奠定基础.方法 首先利用microRNA (miRNA)芯片技术分别检测胎龄16 d、19 d和21 d胎鼠肺组织中miRNA-126*的表达水平,进而应用miRGen2.0数据库通过生物信息学方法预测其可能的靶基因,然后对其靶基因集合应用Cytoscape及其插件BiNGO进行功能富集分析(GO-analysis),后应用DAVID数据库进行靶基因信号转导通路富集分析(KEGG Pathway analysis).结果 miRNA-126*表达量在胎龄16 d、19 d和21 d3组胎肺组织间逐渐上升.miRNA-126*预测靶基因共有422个,其靶基因集合功能富集于葡萄糖醛酸转移酶、糖代谢等分子功能,多细胞器官发育、发育进程等生物学过程及细胞分隔、细胞器界膜等细胞组分上.信号转导通路则显著富集于RNA降解信号通路,以及朊蛋白疾病信号通路中.结论 本研究结果提示miRNA-126*参与了大鼠胎肺发育过程,为今后研究肺发育提供理论基础.
关键词： miRNA-126* 生物信息学 肺发育 大鼠 -
miRNA-126/miRNA-126*在大鼠正常胎肺发育过程中的作用
目的 探讨miRNA-126/miRNA-126*在大鼠胎肺发育中的表达水平及其作用.方法 12只孕鼠随机分为3组,每组4只,3组仔鼠分别于胎龄16d、19d组和21 d时取出,运用苏木精-伊红染色在仔鼠胎肺发育的这3个关键时期对胎肺进行形态学观察,随后通过建立microRNA(miRNA)芯片,了解miRNA-126/miRNA-126*在3组仔鼠胎肺中的基本表达趋势,进而挑选出miRNA-126*并应用real-time PCR对其表达水平行进一步研究.结果 miRNA-126在3组芯片间表达无明显差异,而miRNA-126*随着肺发育进程表达量逐渐上升；采用real-time PCR对miRNA-126*表达进行进一步检测,结果亦显示miRNA-126*随着肺发育进程表达量逐渐上升,组间两两比较差异均有统计学意义(P＜0.05).结论 miRNA-126*可能在大鼠胎肺发育中起着重要作用.
关键词： 肺发育 miRNA-126* miRNA-126 大鼠
