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VacA活性文献资料
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中国幽门螺杆菌vacA基因型标签序列与VacA活性关系的分子系统发育分析
目的 探讨中国幽门螺杆菌vacA基因s、m和i区氨基酸序列分子系统发育关系及其对VacA活性的影响.方法 从GenBank数据库中下载所有中国幽门螺杆菌VacA全长氨基酸序列,利用ClustalX 2.0和MEGA 5.05软件对vacA基因s、m和i区氨基酸序列及VacA全长氨基酸序列进行生物信息学分析,构建分子系统发育树.结果 中国幽门螺杆菌无毒弱毒株vacA基因型全为s1/m2/i1型,而强毒株除Ch2菌株为m1 -m2杂合型之外,全为s1/m1/i1型,s1型和i1型强相关.分子系统发育分析显示,中国幽门螺杆菌vacA基因s、m和i区氨基酸序列都呈现明显的地理特异性,其中m区分子系统发育树能够将VacA强毒株和无毒弱毒株分开,而s和i区分子系统发育树则不能将两者完全分开.结论 vacA基因m区氨基酸序列更适合作为中国幽门螺杆菌VacA的毒力标志.
