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  • 基因芯片筛选经 NFE2 L2-RNAi 转染的乳腺癌耐药细胞差异表达基因 CDCA4

    作者:李奉喜;吴向华;徐钰驹;覃雅;廖清华

    目的:应用基因芯片技术探讨Nrf2与乳腺癌化疗耐药可能相关的下游通路。方法选择人乳腺癌多柔比星耐药细胞株 MCF-7/ADM作为研究对象,经NFE2L2-RNAi成功转染,敲除NFE2L2目的基因,应用RT-PCR方法检测目的基因的表达情况,用人类表达谱芯片检测多柔比星耐药细胞株 MCF-7/ADM与敲除目的基因后的MCF-7/ADM基因表达谱的变化。结果通过比较,发现经NFE2L2-RNAi转染的人乳腺癌多柔比星耐药细胞株和人乳腺癌多柔比星耐药细胞株MCF-7/ADM的基因表达存在明显差异。人基因表达谱芯片中共筛选出差异有统计学意义的基因878个,包括表达上调的基因341个,表达下调的基因537个,其中CDCA4表达上调。通过edgeR分析软件,于TCGA公共数据库中,发现CDCA4在大量样本中乳腺癌组织的mRNA表达丰度显著高于癌旁组织。结论通过基因芯片筛出位于Nrf2下游的CDCA4,与乳腺癌细胞对多柔比星的耐药可能存在密切关系。

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