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采用网络药理学研究桃仁-红花药对治疗股骨头坏死的分子机制
目的:研究桃仁-红花药对治疗股骨头坏死(ONFH)的作用机制.方法:采用网络药理学方法.以化合物口服利用度(OB)>30%和类药性(DL)>0.18为标准,通过中药系统药理学分析平台(TCMSP)、反向分子对接服务器(DRAR-CPI)、人类基因数据库(GeneCards)和在线《人类孟德尔遗传》数据库(OMIM)筛选桃仁-红花药对的活性成分及治疗ONFH的作用靶标.借助网络拓扑属性分析软件Cytoscape 3.6.0构建活性成分-ONFH靶标网络.结合STRING数据库构建靶蛋白相互作用网络,筛选连接度排名前5的靶蛋白,并利用分子对接服务器预测其与桃仁-红花药对活性成分的结合活性.利用生物学信息注释数据库(DA-VID)对靶点基因本体(GO)生物过程和京都基因与基因组百科全书(KEGG)中代谢通路进行富集分析.结果:从桃仁-红花药对中筛选出活性成分44个,包括黄芩苷、槲皮素等,与ONFH相关的作用靶点78个,包括血管内皮生长因子(VEGF)、内皮细胞生长抑制因子(VEGI)、急性C反应蛋白(CRP)等.经分子对接服务器分析发现,桃仁-红花药对的活性成分与靶蛋白结合能力较强.经GO和KEGG通路富集分析发现,桃仁-红花药对治疗ONFH的生物过程与凋亡过程负向调节、核转录因子κB活动的正向调节等有关,主要通过调节分泌型糖蛋白信号通路、黑色素生成信号通路、VEGF信号通路、基底部细胞癌信号通路、腺苷酸活化蛋白激酶信号通路等发挥作用.结论:本研究初步明确了桃仁-红花药对治疗ONFH的主要靶标和通路,可为后续进一步研究其药理作用奠定基础.
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基于网络药理学研究温胆汤治疗冠心病的作用机制
目的:基于网络药理学研究温胆汤治疗冠心病的作用机制.方法:以化合物的口服药物生物利用度(OB)和类药性(DL)为标准,借助中药系统药理学分析平台(TCMSP)、OMIM和Genecards数据库、反向分子对接服务器(DRAR-CPI)筛选并预测温胆汤的活性成分及治疗冠心病的作用靶标.借助Cytoscape 3.6.0软件构建温胆汤活性成分-冠心病作用靶标网络;借助STRING数据库构建靶蛋白相互作用(PPI)网络,筛选连接度(PPI网络中节点通过边的个数)排名前5的靶蛋白,并利用分子对接服务器预测其与活性成分的结合活性.通过生物学信息注释数据库(DAVID)对靶点基因本体(GO)生物过程和京都基因与基因组百科全书(KEGG)中代谢通路进行分析.结果:从温胆汤中共筛选出147个活性成分,143个与冠心病相关的作用靶点,包括白蛋白、载脂蛋白E、白细胞介素6、肿瘤坏死因子、C反应蛋白等.经分子对接分析,温胆汤活性成分与靶蛋白结合能力较强.经GO和KEGG通路富集分析,参与RNA聚合酶Ⅱ启动子转录调控、胆固醇代谢、低氧反应、药物反应、炎症反应等多种生物过程,调节包括脂肪细胞脂解作用通路、细胞因子-细胞因子受体相互作用通路、脂肪消化与吸收通路、过氧化物酶体增殖物激活受体信号通路、肾素-血管紧张素等通路.结论:温胆汤的活性成分能通过多个靶点、多条通路发挥治疗冠心病的作用,本研究结果为进一步研究温胆汤的药理作用提供了参考依据.
关键词: 温胆汤 作用机制 冠心病 网络药理学 中药系统药理学分析平台