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  • 基于SCORE函数估算HLA-A*0201限制性CTL表位亲和性

    作者:朱波;林治华;陈正堂;吴玉章

    目的建立HLA-A*0201限制性CTL表位亲和性的定量预测方法.方法基于SCORE打分函数,运用定量构效关系的理论和方法研究了HLA-A*0201限制性CTL表位九肽结构与亲和性间的定量关系,并建立了SCORE得分与亲和性的定量关系模型,并用外部样本(5个HLA-A*0201限制性CTL表位九肽)作为预测集用于检验模型的预测能力.结果基于SCORE打分函数建立的定量模型具有较好的相关性(r=0.9165,RMS=0.38)和对外部样本的预测能力(rpred=0.9847,RMS=0.135).结论基于SCORE打分函数,运用定量构效关系研究的理论和方法建立了HLA-A*0201限制性CTL表位亲和性的定量预测方法,为实验鉴定高亲和性HLA-A*0201限制性CTL表位提供了理论依据.

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