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变异链球菌荧光报告株与野生菌株生长能力及生物膜形成能力的比较
目的:评价变异链球菌荧光报告株(UA140-mrfp)与野生菌株(UA140)生长能力、生物膜形成能力的差异.方法:测定报告株与野生菌株生长曲线,生物膜形成量,扫描电镜观察不同时间段生物膜结构,利用SPSS 10.0统计软件进行重复测量设计方差分析.结果:报告株与野生菌株的生长曲线可明显看出3个阶段,均是在0～2 h为迟缓期,2～6 h为对数生长期,6 h以后为稳定期;同期各时间点报告株相比野生菌株A_(600)值略低,但无明显差别.组间比较发现两菌株生物膜形成量无统计学意义(P>0.05).不同时间段生物膜结构相近,高倍镜下细菌形态无改变.结论:报告株与野生菌株生长能力,生物膜形成能力相近,可用报告株代替野生菌株在激光共聚焦显微镜下研究变异链球菌的生物膜结构.
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2株枯草芽孢杆菌全基因组重测序分析
目的:研究枯草芽孢杆菌的野生菌株(environmental strain)和驯化菌株(domesticated strain)基因组差异,为后续研究枯草芽孢杆菌分泌抗菌相关物质能力提供数据支持.方法:对2株枯草芽孢杆菌野生菌株Km及CMCC63528进行全基因组测序,并与实验室驯化菌株B.subtilis 168进行序列比较.利用进化树分析菌株的关系;利用皮尔逊相关系数分析菌株间蛋白基因的序列变化关系;用错义突变和同义突变频率计算转化相关基因的序列变化.结果:2株野生菌株与B.subtilis 168相比各有20000多个单核苷酸多态性位点(single nvcleotide polymorphism,SNP),其中9217个SNP是2株野生菌共有的.进化分析发现2株菌属于subtilis亚种,其错义突变基因显著相关,前100个高度变化的错义突变基因有1/3是相同的.2株野生菌中comG operons,comC,comEC和nucA等与转化及分泌相关基因的序列与B.Subtilis 168相比均发生了显著改变.结论:2株枯草芽孢杆菌野生菌株和驯化菌株之间有明显的序列差异,2株野生菌株之间相对于驯化菌株其序列变异的基因高度相关.野生菌株和驯化菌株间与蛋白分泌及DNA提取相关的基因序列变化明显.该数据为研究和改造枯草芽孢杆菌以提高其生产和分泌抗菌物质的能力提供一定的序列依据.
