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Vpu基因文献资料
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哈尔滨市41例HIV-1感染者Vpu基因特征分析
目的 了解哈尔滨市未经抗病毒治疗HIV-1感染者人群中部分感染者HIV-1 Vpu基因亚型和变异特征.方法 采集哈尔滨市50例未经抗逆转录病毒治疗的HIV-1感染者的抗凝全血,分离外周血单核细胞(PBMC)提取前病毒基因组DNA,用巢氏聚合酶链反应(Nested-PCR)对HIV-1 Vpu基因进行扩增,并使用产物直接测序.应用Sequencher 4.9进行序列清理,Bioedit和MEGA5.05软件进行序列比对及系统发生分析.结果 50例HIV-1感染者的抗凝全血样本中终有41例(82.0％)成功扩增并完成测序分型.系统进化树显示该41例中34例感染者体内HIV的Vpu基因区与云南瑞丽株RL42(泰国B亚型)聚集在一起,属于B'亚型,7例属于欧美B亚型.各病毒株Vpu区组内离散率为(9.5±1.1)％,与国际标准毒株(HXB2)线性分析可发现某些区域的氨基酸变异,变异主要集中在10～47、70～104、115～147、174～205四个区域.结论 哈尔滨市未经抗病毒治疗HIV-1感染者人群中存在属B'亚型和欧美B亚型病毒流行株,其中属B '亚型的流行株有可能起源于云南吸毒人群流行株.Vpu在组内有一定的保守性,其结构性区域和基序可能为日后抑制HIV-1病毒的复制和释放提供理论指导.
关键词： 人类免疫缺陷病毒Ⅰ型(HIV-1) Vpu基因 变异
