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种系发生学文献资料
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宁夏地区人畜BDV p24基因系统发生树构建和序列分析
目的 了解宁夏及其周边地区博尔纳病病毒(BDV)的感染状况和基因特征及其种系发生来源.方法 采用巢式反转录实时荧光定量聚合酶链反应(FQ-nRT-PCR),检测119例病毒性脑炎(VE)患者和其密切接触的患病或健康牛205头、绵羊978只及脑血管病患者46例、多发硬化患者13例的外周血单核细胞BDVp24片段,检出的阳性序列连同前期检出的宁夏绵羊、VE患者和抑郁症患者阳性BDVp24基因序列与GenBank中5个国家7个动物种属29例BDVp24基因序列进行比对,分析其核苷酸和氨基酸序列的同源性,重新构建基因系统发生树.结果 23例阳性检测标本连同3例前期检测序列基因聚合分析显示核苷酸之间的同源相似度为96.5%～100.0%,氨基酸的同源相似度为95.3%～100.0%.与德国马源性标准株HE80同源相似度较高.构建基因的系统发生树发现宁夏绵羊、VE患者和抑郁症患者同德国马和绵羊、奥地利马都各自形成了独立的支系,其余样本形成混合支系,其中宁夏的VE患者、牛、绵羊同德围马、日本绵羊形成德国-中国宁夏-日本混合支系.结论 宁夏及其周边地区人和动物BDV的感染,存在区域源性BDV独立株和国外传人基冈保守株的多源状态.
