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钾-氯协同转运子1新的同分异构体的发现及其转录调控意义
目的寻找钾-氯协同转运子(KCC)1新的同分异构体及分析其意义.方法抽提正常人肾组织RNA,用已发表KCC1序列设计引物,进行cDNA末端快速放大(RACE)及RT-PCR,以Northern印迹分析证实新的同分异构体的存在,并用生物信息学方法比较新序列.结果RACE和Northern印迹分析结果证实在人肾组织中有3种KCC1的新的同分异构体,与野生型KCC1不同的是,新的KCC1同分异构体2含部分内含子1的序列(外显子1b),作为其外显子1,蛋白翻译起始密码子也位于该外显子中.新的KCC1同分异构体3含外显子1b、外显子2、内含子2及以后与野生型KCC1相同的序列,蛋白翻译起始密码子位于外显子4,导致一长的5'端非翻译区,内含子2靠外显子3的位置有一翻译终止密码子.新的KCC1同分异构体4含部分内含子3作为其5'端非翻译区.结论新的异构体的发现为KCC家族增添了新的成员,并为KCC1这一重要分子的转录和功能调节提供了新的线索,其特异性序列可用于分析它们在人类疾病中的病理意义.由于启动子类型的不同对同分异构体基因转录的选择起主动的调节作用,多个同分异构体及多个启动子的存在对理解KCC1复杂的生理功能、调节过程和致病机制具有重要意义.
关键词: 钠钾氯化物协同转运子 RNA剪接 立体异构体 基因调节