首页 > 文献资料
-
红曲菌株鉴别中SCAR分子标记的应用
目的:建立一套基于DNA遗传标记技术的红曲菌株快速鉴定方法.方法:采用RAPD方法对分离收集的10个红曲菌株进行多态性分析,从菌株F中获得1个421 bp的特异RAPD标记片段F421.Blast分析未发现F421序列(GenBank登录号EF063107)与GenBank中相关序列有较高同源性.根据该序列设计特意引物,对10个红曲菌株进行PCR检测.结果:利用所获得的特征性片段扩增区域(SCAR)标记能能在1 d内准确地鉴别出红曲F菌株.结论:利用SCAR分子标记技术对红曲菌株进行分类鉴别是红曲研究领域的新尝试,为推广应用SCAR分子标记技术对药用真菌进行菌株快速准确鉴定提供技术依据.
-
南、北五味子RAPD-SCAR鉴别研究
目的:为准确鉴别南五味子和北五味子寻找一种新的鉴别手段.方法:采用RAPD-SCAR技术对南、北五味子基因组DNA进行PCR扩增.结果:100条RAPD引物中筛选出2条条带清楚、重复性好的RAPD引物能够区分南、北五味子,并将其转化为SCAR标记.结论:RAPD-SCAR技术是在分子水平上鉴别南、北五味子的一种行之有效的方法.
-
中药山茱萸SCAR标记的研究
目的:建立山茱萸的SCAR标记,为山茱萸药材分子鉴定提供科学依据.方法:用随机引物进行RAPD筛选,获取特异的RAPD标记条带,分离提取RAPD标记条带,进行克隆和测序,根据测定RAPD标记条带的两端序列设计1对特异引物进行常规PCR反应,获得SCAR标记.结果:根据RAPD标记条带的序列设计筛选了4对特异引物,其中YST38,YST43分别对7个山茱萸品种样本的DNA进行SCAR扩增,7个山茱萸栽培品种均能产生单一的PCR条带,可以用作山茱萸的鉴别;而YST38对圆柱形果型、长梨形果型还有1条特异性条带,可以做为这2个品种的鉴别依据;YST39对7个山茱萸品种进行扩增,纺锤形果型样本的谱带大小(350～400 bp)比其余6个果型的谱带大小(650～700 bp)短了300 bp左右,这条谱带可以做为纺锤形果型的鉴别依据;YST92对圆柱形果型、长梨形果型均产生了1条600～700 bp的条带,椭圆形果型、短圆柱形果型产生了1条200～300 bp的条带,长圆柱形果型、纺锤形果型、短梨形果型3个果型无扩增,YST92可用来筛选山茱萸的几种果型.结论:建立的SCAR标记,条带清晰明亮,结果稳定,可作为山茱萸品种选育和药材分子鉴定的依据.
-
基于RAPD标记的SCAR分子标记技术鉴定川牛膝及其混淆品
目的:基于RAPD标记开发SCAR标记,为川牛膝及其混淆品鉴定提供有效方法.方法:建立了收集于四川天全、宝兴、会理、金口河等地的19个牛膝种群(包括川牛膝及其混淆品红牛膝、怀牛膝)的RAPD指纹图谱,从中找到能有效区分上述材料的多态性谱带F300,F500进行克隆与测序;根据测序结果设计2对特异引物对19份材料进行PCR扩增.结果:引物SC-320能稳定地区分川牛膝与怀牛膝,引物SC-495则能稳定地区分川牛膝与红牛膝,2对引物结合能快速准确地鉴定川牛膝、红牛膝和怀牛膝.结论:建立了鉴定川牛膝及其混淆品的SCAR标记技术体系.
-
基于SCAR分子标记的头花蓼分子鉴定研究
目的:建立快速准确的头花蓼与尼泊尔蓼药材的分子标记鉴定方法.方法:通过RAPD随机引物筛选,获得头花蓼特异的RAPD分子标记片段,经克隆、测序,重新设计特异性引物转化形成稳定的SCAR标记.结果:获得2条稳定扩增的头花蓼特异片段Z300,Z1100,根据该2特异片段序列设计4对特异引物,分别对头花蓼与尼泊尔蓼药材DNA进行扩增,其中引物Z1-2可从头花蓼药材中扩增获得约300 bp的片段,而尼泊尔蓼药材则未扩增出该片段.结论:引物Z1-2成功将Z300片段转化为SCAR分子标记,可作为头花蓼与近缘种尼泊尔蓼药材分子鉴定的依据.
-
金线莲RAPD-SCAR标记的开发和种质遗传多样性评价
目的 研究不同种质资源金线莲Anoectochilus roxburghii的遗传进化关系,开发高效、实用的分子标记方法.方法在20个不同产地金线莲种质资源的基础上开发RAPD标记,并将其换成特异SCAR标记.结果 从100条RAPD随机引物中筛选出28条具有显著多态性的引物,扩增得到135条多态性位点.RAPD聚类分析显示,当20个金线莲种质资源平均遗传距离为0.748时,可以聚为6类,同一区域起源金线莲基本归为一类,表明不同区域金线莲种质资源存在着显著遗传差异.在此基础上,从多态性RAPD条带中挑选出5个特异位点转换为SCAR标记,并在不同金线莲种质资源中进行验证,结果 显示5条SCAR标记具有显著的种质资源特异性和扩增模式.结论 所筛选的特异RAPD-SCAR标记为加快金线莲优良品种选育进程奠定坚实基础.
-
铁皮石斛的SCAR标记研究
目的:建立快速准确的铁皮石斛DNA分子鉴定方法.方法:采用RAPD方法对11种石斛进行多态性分析,获得铁皮石斛特异的RAPD分子标记片段;经克隆、测序,重新设计一对特异性引物转化成稳定的SCAR标记.结果:获得了1条稳定扩增的铁皮石斛特异的片段DS-302,序列测定结果表明,全长302 bp,通过BLAST搜索、同源性比较,结果表明该段序列与已知数据库中的所有序列无显著同源性.根据该序列设计1对特异引物,对11种石斛进行扩增,可在铁皮石斛中扩增获得约300 bp的片段,而石斛属其他种未出现该条带.结论:DS-302成功转化为SCAR分子标记,可对铁皮石斛进行快速有效的鉴定.
-
大麻性别连锁SCAR标记特异性检测
目的 检测分析大麻性别连锁SCAR标记对于中国大麻性别的特异性,为植株性别鉴别研究积累资料.方法 分别收集中国云南、新疆、甘肃、山西等4个不同地区大麻雌雄植株各15份,共计120份.参考文献设计合成SCAR标记引物,对样本进行扩增和琼脂糖凝胶电泳检测,并随机抽取样本进行盲测验证.结果 120份已知性别的大麻样本经检测,其中113份样本结果正确,总正确率94.2％;16份随机盲测样本经检测,15份结果正确,正确率为93.8％.结论 SCAR323与SCAR119标记可被用作中国大麻性别的鉴别.
