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龙骨马尾杉PcHDR1基因克隆及序列分析
该研究采用RT-PCR方法对龙骨马尾杉Phlegarirus carinatus (Desv.) Ching 1-羟基-2-甲基-2-(E)-丁烯基-4-焦磷酸还原酶[1-hydroxy-2-methyl-2-(E)-butenyl 4-diphosphate reductase,HDR1基因PcHDR1的编码区进行克隆并利用生物信息学方法进行序列分析.根据实验室已获得的龙骨马尾杉转录组数据,从中获得1条编码HDR的转录本,采用RT-PCR方法获得该基因的全长cDNA序列,所克隆的PcHDR1基因编码区长为1 437 bp,编码478个氨基酸残基,GenBank登录号为JQ957845.PcHDR1与银杏Ginkgo biloba的HDR序列同源性高,达78％.生物信息学预测PcHDR1蛋白没有跨膜区,具有LytB保守结构域,不含信号肽.该研究克隆并获得了龙骨马尾杉PcHDR1基因的编码区序列,并对其编码的蛋白进行了序列分析及结构域预测,为进一步研究HDR的功能奠定基础.
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番茄萜类生物合成途径研究进展
番茄中的萜类代谢既对植株本身生长产生影响,又对番茄果实的品质和颜色有着巨大的作用.番茄中大部分萜类化合物均属于类胡萝卜素类,都是通过萜类化合物通路合成的包括3个乙酰辅酶A分子缩合成3-甲基-3,5-二甲基戊酸(MVA),MVA在酶的作用下磷酸化形成焦磷酸酯,脱羧后形成异戊二烯焦磷酸(IPP);IPP在IPP异构酶(IPPI)的作用下异构化生成甲叉双丙烯焦磷酸(DMAPP),牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合成酶(GGPPS)催化DMAPP与3个IPP分子缩合生成牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸(GGPP).2个GGPP分子在八氢番茄红素合成酶(PSY)的催化下聚合成八氢番茄红素(40碳);八氢番茄红素脱氢酶(PDS)催化八氢番茄红素成ζ-胡萝卜素,ζ-胡萝卜素在ζ-胡萝卜素脱氢酶(ZDS)的作用下生成番茄红素;在番茄红素β环化酶(LCYb)和ε环化酶(LCYe)的作用下进一步发生环化反应,分别合成α胡萝卜素和β胡萝卜素;P450类胡萝卜素对此继续作用,通过2步羟化反应生成叶黄素.就番茄中的萜类代谢途径的关键酶基因进行了详细阐述,并对其新研究进展进行了概括,同时展望了其发展前景.
