首页 > 文献资料
-
痘苗病毒基因组密码子使用频率分析
密码子使用的差别是普遍存在的现象,每一个密码子被某些生物偏爱,而在另一些生物中则很少使用.以往这方面的研究多集中在自养生物中,而对纯寄生的病毒本身及其与宿主细胞基因密码子使用频率关系的研究则很少.分析痘苗病毒哥本哈根株189个基因的密码子使用频率发现:总体上痘苗病毒偏爱使用以A/U为结尾的密码子;基因的异质性不强,没有影响密码子使用的主要趋势;在不同转录方向上和表达时相上,基因密码子使用略有不同;不同功能的基因其密码子使用上差别较大;晚期基因比早期基因与宿主密码子使用频率的差别大.上述结果表明:密码子是影响病毒和细胞相互作用、保证其自身生存的重要机制.
-
恶性疟原虫的基因表达水平对密码子使用的影响
-
翻译水平棘球绦虫属密码子使用上存在趋向性选择的依据
-
口蹄疫病毒O型与A型编码基因的密码子使用
对于54个编码口蹄疫病毒 O型和A型多聚蛋白质编码序列密码子使用的方差分析表明,这两种血清型多聚蛋白质的密码子(GCC、GCG、AGA、CGG、GGC、GGU、CAC、CAU、AUA、AUU、CUG、CCC、AGC、UCU、ACA、ACC、ACG、ACU)使用偏性有显著区别.然而,通过对氨基酸使用偏性的分析,我们只是找出Ala、Arg、Leu、Phe、Ser在O和A型多聚蛋白质中的使用偏性有显著差异.由此我们发现,密码子的使用偏性比氨基酸使用偏性能提供更多的信息.通过对A型和O型的密码子使用整体性分析,两者密码子使用偏性的相似性可能与tRNA丰度相关的.这些密码子使用偏性的内在联系表明口蹄疫病毒 A型和O型的基因组变异所涉及到同义密码子的选择上可能存在着某种选择机制.