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脂酰辅酶A合成酶文献资料
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结核分枝杆菌FadD3结构与功能的生物信息学分析
目的 应用生物信息学分析软件预测结核分枝杆菌脂酰辅酶A合成酶(FadD3)氨基酸序列的结构与功能.方法 应用生物信息学在线工具NCBI (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/)、Expasy(http://ca.expasy.org/)、SWISS-MODEL(http://swissmodel.expasy.org/)、客户端软件clustalx等进行多重序列比较、同源性分析、同源模建及蛋白功能活性位点分析;应用ProtParam软件(http://web.expasy.org/protparam)预测FadD3基因编码FadD3的蛋白理化性质;采用小值进化法(the Minimum Evolution method)构建分子进化树. 结果 FadD3 (Mt-FACS)与其他物种的脂酰辅酶A合成酶(FACS)含相同的保守序列及催化活性位点,第174-185氨基酸残基是AMP结合部位,也是FadD3的保守区域;第422-497氨基酸残基是FACS与底物(脂酸)结合的部位,亦是结核分枝杆菌脂酰辅酶A合成酶的C末端.分子进化分析表明结核分枝杆菌脂酰辅酶A合成酶(Mt-FACS)与睾丸酮丛毛单胞菌脂酰辅酶A合成酶(Ct-FACS)的进化关系较近,与黑腹果蝇脂酰辅酶A合成酶(Dm-FACS)的进化关系较远. 结论 生物信息学预测提示FadD3是结核分枝杆菌脂类代谢及耐药性研究的潜在靶蛋白.
