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GB病毒C型基因组文献资料
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从MT2、HeLa细胞DNA及人和黑猩猩PBMC DNA中扩增GBV-C核苷酸
目的检测MT2和HeLa细胞DNA、6例人和1例黑猩猩PBMC DNA中是否存在与GBV-C同源的核苷酸序列。方法直接以上述DNA为模板、采用GBV-C 5′-NCR和NS3区引物的直接套式PCR(dPCR)、核苷酸序列分析、引物介导原位扩增(PRINS)NDA序列特异荧光标记技术。结果从MT2和HeLa细胞DNA、4例人PBMC DNA标本中获得5′-NCR引物扩增片段,从MT2和HeLa细胞DNA、5例人和黑猩猩PBMC DNA标本中获得NS3区引物扩增片段。这些扩增产物的核苷酸序列与GBV-C同源性分别为74.29%~77.14%和73.80%~79.15%。PRINS检测结果显示,dPCR阳性的PBMC及其染色体上有荧光着色。结论 MT2和HeLa细胞DNA、人和黑猩猩PBMC DNA中存在与GBV-C 5′-NCR和/或NS3区同源性较高的核苷酸序列,这些序列可能位于dPCR阳性的PBMC染色体上。
关键词: GB病毒C型基因组 外周血单个核细胞DNA 聚合酶链反应 核苷酸序列