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以LongSAGE方法寻找不同菌相生长白念珠菌细胞差异表达基因
目的以长片段基因表达系列分析技术(LongSAGE)寻找酵母相和菌丝相生长的白念珠菌细胞差异表达基因.方法采用LongSAGE方法,分别构建白念珠菌酵母相和菌丝相细胞LongSAGE标签文库,比较文库获得不同菌相生长白念珠菌细胞差异表达基因.结果成功构建了白念珠菌酵母相和菌丝相细胞的LongSAGE标签文库,比较文库获得了白念珠菌酵母相和菌丝相细胞间差异表达的单基因匹配标签.结论用LongSAGE方法较完整地获得了白念珠菌酵母相和菌丝相细胞基因表达谱及其丰度的量化信息,文库间比较可获得不同菌相生长白念珠菌差异表达基因.
关键词： 白念珠菌 二态性 长片段基因表达系列分析 -
白念珠菌酵母相细胞长片段基因表达系列分析文库的构建和初步分析
目的 构建白念珠菌酵母相细胞长片段基因表达系列分析文库并探讨其基因表达特点.方法 采用长片段基因表达系列分析技术(LongSAGE)构建白念珠菌酵母相细胞LongSAGE文库,并从中挑取1 000个阳性克隆进行测序.结果 成功构建了白念珠菌酵母相细胞LongSAGE文库.1 000个测序文件中,共获得标签17 773个,代表单一转录本7 333种,其中单一匹配标签占16.65%,多重匹配标签占6.59%,推测蛋白标签占16.27%,基因组及粘粒等标签占1.64%,新标签为58.86%.标签拷贝数超过35的33个高表达标签中有11个可能属于新的表达序列.结论 LongSAGE是一种能够快速、高通量地研究细胞基因表达谱及其丰度的方法,可发现新的表达序列.
关键词： 念珠菌 白色 二态性 基因表达谱 长片段基因表达系列分析 -
菌丝相白假丝酵母菌长片段基因表达系列分析文库的构建及结果分析
目的构建菌丝相白假丝酵母菌长片段基因表达系列分析文库并探讨其基因表达特点.方法采用长片段基因表达系列分析技术(LongSAGE)构建菌丝相白假丝酵母菌LongSAGE文库,从文库中挑取阳性克隆测序,用SAGEsoftware对测序结果进行分析和检索,从而了解菌丝相白假丝酵母菌基因表达情况.结果在菌丝相白假丝酵母菌的1 000个测序文件中,共获得标签17 552个,代表单一转录本6 627种,其中单一匹配标签占20.5%,多重匹配标签占6.64%,假设蛋白标签为18.47%,新标签为53.07%.标签拷贝数超过35拷贝的36个高表达标签中有15个可能属于新的表达序列.结论用LongSAGE技术获得了菌丝相白假丝酵母菌基因表达谱及其丰度的量化信息,可以发现新的表达序列,为进一步研究提供了基础.
关键词： 白假丝酵母菌 二态性 长片段基因表达系列分析
