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AS-PCR检测丙型肝炎患者IL28B rs12979860基因多态性
目的 评价等位基因特异性PCR(AS-PCR)检测白介素28B(IL28B) rs12979860基因多态性在预测丙型肝炎患者抗病毒治疗效果中的应用价值.方法 选取2011年5月至2012年5月武汉大学人民医院感染科174例丙型肝炎住院患者外周血,针对rs12979860基因多态性设计特异性引物2对,并在反向引物3'末端第2或第3碱基处引入突变碱基,用AS-PCR检测30例丙型肝炎患者rs12979860基因多态性,并用基因测序法平行验证,比较2种检测方法的符合率、敏感度和特异度.然后采用AS-PCR方法分析174例丙型肝炎患者rs12979860不同基因型在人群中的分布频率.结果 AS-PCR和测序法平行检测30例丙型肝炎患者,均能有效鉴别rs 12979860基因的CC型、CT型和TT 型,二者符合率为100％(x2 =60.0,P＜0.01),特异度和敏感度也均为100％.以CC基因型为对照,AS-PCR检测TT基因型灵敏度为10-5,测序法为2×10-1.用AS-PCR法从174例丙型肝炎患者中,检出rs12979860基因的TT型、CC型和CT型的分布频率分别为3.5％ (6/174)、13.2％ (23/174)和83.3％(145/174).结论 AS-PCR法可快速、准确、可靠、经济、有效地检测丙型肝炎患者IL28Brs12979860基因多态性,适于各大医院预测丙型肝炎患者抗病毒治疗效果.
