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晚期卵巢癌的血浆蛋白质组学模型用于早期卵巢癌诊断的初步研究
目的 探讨用晚期卵巢癌的血浆建立的蛋白质组学诊断模型用于早期卵巢癌诊断的可行性.方法 采用表面增强激光解吸/离子化飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS) 技术,对33例晚期(FIGO Ⅲ、Ⅳ期)卵巢癌及31例对照血浆标本进行检测, 结合生物信息学的支持向量机(support vector machines, SVM)方法用晚期卵巢癌和对照组血浆的蛋白质谱建立诊断模型;运用此模型对11例早期(FIGOⅠ、Ⅱ期)卵巢癌进行盲法测试以探讨用于早期卵巢癌诊断的可行性.结果 应用SELDI-TOF-MS结合SVM方法建立了由晚期卵巢癌7个差异蛋白峰组成的蛋白质谱优化诊断模型,这7个蛋白峰中质荷比(m/z)为4099、5488、4144、4478、3940的蛋白在晚期卵巢癌中的表达上调,质荷比(m/z)为13783、8588的蛋白表达下调;所建模型对11例早期卵巢癌进行盲法测试,9例预测正确,预测准确率为9/11(81.82%).结论 SELDI-TOF-MS结合SVM方法建立的晚期卵巢癌蛋白质谱诊断模型对多数早期卵巢癌也有诊断价值,但应扩大样本量进行更为深入的研究和统计分析.
关键词： 卵巢癌 早期诊断 蛋白质组学 表面增强激光解吸/离子化飞行时间质谱 -
应用蛋白质芯片技术筛选急性淋巴细胞白血病患儿血清标志物的研究
目的 探讨儿童急性淋巴细胞白血病(ALL)急性期、缓解期(CR)患儿血清蛋白质谱的变化,旨在筛选可用于ALL早期诊断、病情变化监测及预后判断的蛋白质标志物.方法 应用蛋白质芯片CM10及表面增强激光解吸/离子化飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术获得ALL、正常健康儿童血清蛋白表达指纹图谱,并用Biomarker Wizard和Biomarker Patterns System 5.0软件对数据进行分析,建立诊断模型.结果 通过检测、分析发现,ALL组与正常对照组比较有显著差异(P＜0.05)的蛋白质峰有14个,并获得质荷比(M/Z)为2770.43、7576.2和5288.68的蛋白质在ALL患儿血清蛋白质谱中波峰强度明显升高;进一步利用这3个蛋白质建成的诊断模型,可将ALL与正常儿童正确分组,其正确分组率分别为93%(25/27)和90%(19/21).ALL完全缓解后血清蛋白质谱中,原高表达的蛋白质明显下调.结论 SELDI-TOF-MS蛋白质芯片技术是一种快速、简单易行、用量少和高通量分析方法,能够直接检测出ALL患者血清中特异的蛋白标志物,其对于ALL的早期诊断具有一定的临床意义.
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表面增强激光解吸/离子化蛋白质芯片技术在肝细胞癌早期诊断研究中的应用
随着蛋白质组学研究技术的飞速发展,集样品分离、纯化、检测和数据分析为一体的表面增强激光解吸离子化飞行时间质谱蛋白质芯片技术已成为蛋白质组学研究的有力工具,它可以快速、简便地直接检测各种体液及分泌物,具有标本用量少、高通量分析等特点,并在筛选、鉴定肿瘤标志物及临床疾病的诊断、防治方面发挥了重要作用.本文介绍了该技术的特点和分析步骤,以及该技术在肝细胞癌早期诊断中的应用情况,并对其前景进行展望.
关键词： 蛋白质芯片 表面增强激光解吸/离子化飞行时间质谱 肝细胞癌 -
血清和血浆中血栓蛋白差异的研究
目的:研究血清与血浆中血栓蛋白的差异,探索临床检验血标本的佳取材方式.方法:采用表面增强激光解吸/离子化飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术,并选用CM10蛋白质芯片对8名志愿者的血清和血浆标本分别进行检测,经Proteinchip Software 3.2软件采集原始数据后,采用Ciphergen公司的Biomarker Wizard软件分析血清及血浆标本中所有质荷比(m/z)蛋白丰度的差异,以初步探讨血清和血浆中血栓蛋白的差异.结果:经Biomarker Wizard软件分析,显示2类标本间共有18个蛋白丰度有显著性差异,其中m/z为1 872、1 902、1 923、1 993、2 144、2 193、2 745、3 402、15 147的9个蛋白在血浆中含量较高,而m/z为3 162、4 097、4 215、5 645、5 913、7 774、8 150、8 924、9 299的9个蛋白在血浆中含量较低.结论:血清和血浆间存在许多血栓蛋白丰度的差异.因此,在临床检验血液中血栓蛋白时,为尽可能反映血液非细胞成分的在体特征,标本选择血浆可能更佳.
关键词： 血清 血浆 蛋白质组学 差异 表面增强激光解吸/离子化飞行时间质谱
