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利用基质辅助激光解析电离飞行时间质谱联合磁珠技术寻找乳腺癌血清蛋白标志物
目的 探索乳腺癌与乳腺良性疾病和健康人血清蛋白质谱表达差异,寻找具有鉴别诊断意义的血清蛋白标志物.方法实验分为两大组:(1)决策树模型组共293例标本,包括3个亚组,分别为乳腺癌组110例标本、乳腺良性疾病组113例和健康组70例,建立决策树(乳腺癌诊断)模型;(2)盲法验证组共34例标本,包括3个亚组分别为乳腺癌组7例标本、乳腺良性疾病组13例及健康组14例,进行盲筛验证决策树模型.采用弱阳离子磁珠捕获乳腺癌患者血清中的蛋白,使用基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)仪检测绘制蛋白峰.应用Biomarker Wizard TM 3.1软件和Biomarker Patterns TM 5.0 软件分析数据.统计分析采用方差分析法和秩和检验法.计算决策树模型诊断的准确率以及盲法验证模型诊断乳腺癌的敏感性和特异性.结果 在决策树模型组中检测到了47个差异有统计学意义的蛋白峰(P<0.050).应用BPS 5.0软件,以相对损失小的原则从这47个蛋白峰中选取了4个蛋白峰,分别为相对分子质量(Mr,本文中相当于质荷比m/z) 9292.5、Mr 11707.2、Mr 15504.5和Mr 16107.9,用其建立决策树模型(乳腺癌诊断模型).该模型判断乳腺癌、乳腺良性疾病及健康人的准确率分别为99.09%、95.58%、92.86%.盲法验证该模型诊断乳腺癌的敏感性为71.43%,特异性为88.89%.结论 应用MALDI-TOF-MS联合磁珠技术可以检测乳腺癌血清中差异蛋白峰并可以建立决策树(乳腺癌诊断)模型.选择的4个差异蛋白蜂建立的决策树模型诊断乳腺癌具有好的准确性和较好的敏感性及特异性.决策树模型能将乳腺癌与乳腺良性疾病及健康人相鉴别.寻找到的Mr 9292.54、Mr 11707.2、Mr 15504.5以及Mr16107.9的蛋白峰有望成为鉴别乳腺癌与乳腺良性疾病和健康人的有效的肿瘤血清蛋白标记物.
关键词： 乳腺肿瘤 蛋白质组学 基质辅助激光解析电离飞行时间质谱法 磁珠 差异蛋白峰 -
发展蛋白质组学为基础的乳腺癌诊断学的探索
在过去的十余年里,多种基因组学和组织学技术加快了新的乳腺癌诊疗模式的发展,对患者进行分子水平诊断和个性化治疗成为今后的发展趋势.与基因组学和组织学技术快速发展相比较,用于指导乳腺癌的筛查和治疗的肿瘤标志物研究进展却微乎其微,尤其是对血清或组织中乳腺癌特异性标志物的检测.该文就基因组学与蛋白质学在乳腺癌分子诊断学应用进展中存在巨大差距的潜在原因,以及改进蛋白质组学研究设计的策略予以综述.
关键词： 乳腺癌 蛋白质组学 糖蛋白组学 基质辅助激光解析电离飞行时间质谱法
