首页 > 文献资料
-
2013年北京市朝阳区柯萨奇A6型病毒分子流行病学研究
目的 了解2013年北京市朝阳区柯萨奇A6型(Coxsackievirus A6,CVA6)病毒的流行特点及其基因特征.方法 对2013年收集的795份手足口病患者的咽拭子样本进行肠道病毒检测,对非EV71、非CVA16型病毒阳性样本进行CVA6荧光定量PCR检测,选取CVA6阳性样本进行VP1片段(794bp)序列扩增与测序,运用Clustalx软件和MEGA4.0软件对本地区CVA6的VP1片段序列与从NCBI下载的CVA6的VP1参考序列进行聚类分析.结果 肠道病毒通用型核酸阳性样本共计382例(48.1％,382/795),其中非EV71、非CVA16型病毒236例(61.8％,236/382);非EV71、非CVA16型病毒阳性样本中有CVA6型病毒样本185例(78.4％,185/236).基于VP1片段的聚类分析,结果显示2013年该地区的CVA6型病毒与中国地区的参考序列明显聚为一类;CVA6在系统进化树中形成A、B和C等3个基因型,C基因型又可分为C1和C2两个基因亚型;两个基因亚型间的核苷酸序列差异度为10.8％ ～ 13.2％.朝阳区所有的CVA6都位于C基因型,C1亚型包括了大部分该地区序列.结论 2013年该地区的CVA6已经超过了EV71和CVA16,首次成为北京市朝阳区手足口病的主要病原体.该地区存在CVA6的C1和C2两个基因亚型的共循环,其中C1亚型对该地区2013年CVA6的暴发流行起关键作用.
-
2014-2016年孝感地区手足口病流行病学及柯萨奇病毒A6和A5型基因特征
目的 了解2014-2016年孝感地区手足口病流行特点及未知病毒基因特征.方法 通过"传染病报告信息管理系统"下载3年内孝感市辖区内疫情资料进行相关流行病学分析.收集医疗机构采集手足口病临床诊断咽拭子样本共计2548份,经肠道病毒71型(EV71)和柯萨奇病毒A16(CVA16)荧光定量聚合酶链式反应(PCR)检测后仍然不能确定型别的肠道通用型病毒阳性样本作为研究对象,参考美国NCBI基因库,设计特异性引物进行VP1区(395bp)序列扩增分析后进行双向测序.将成功测序的基因片段序列进行VP1区基因片段聚类分析.结果 孝感地区临床疑似病例中,3年内手足口病发病患者0～5岁病例数分别占总疑似病例数的97.74％、97.23％和97.05％;≤5岁儿童中,3年内男女比例分别为1.77:1、1.87:1和1.60:1.基于VP1区片段聚类分析,结果显示3年内本地区CVA6型和CVA5型病毒与中国地区参考序列明显聚为一类.结论 2014—2016年孝感地区手足口病EV17型为主要病原体,CVA16型次之.该次实验首次发现本地区CVA5型和CVA6型病原体.
-
长春地区儿童疱疹性咽峡炎病原研究
目的 了解长春地区2012年、2013年儿童疱疹性咽峡炎主要病原类型.方法 采集2012年、2013年儿童疱疹性咽峡炎患者的咽拭子标本,通过半巢式RT-PCR及VP1区基因序列分析进行病原分型鉴定.结果 本研究采集的110份儿童疱疹性咽峡炎标本中,经鉴定肠道病毒(enterovirus,EV)阳性82份,阳性率为74.55％;其中2012年检测前3位的型别分别为CVA10(18/32)、CVA2(7/32)及CVA3、CVA16(3/32);2013年检测前3位的型别分别为CVA6(25/50)、CVA2(13/26)及CVA4、CVA10(3/50).系统进化树分析结果表明,2012年和2013年吉林省肠道病毒的流行均存在3个或3个以上的传播链.结论 2012年、2013年引起长春地区儿童疱疹性咽峡炎的主要病原分别为CVA10及CVA6,且同期存在不同的传播链.
