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柯萨奇A5型病毒文献资料
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2014-2016年孝感地区手足口病流行病学及柯萨奇病毒A6和A5型基因特征
目的 了解2014-2016年孝感地区手足口病流行特点及未知病毒基因特征.方法 通过"传染病报告信息管理系统"下载3年内孝感市辖区内疫情资料进行相关流行病学分析.收集医疗机构采集手足口病临床诊断咽拭子样本共计2548份,经肠道病毒71型(EV71)和柯萨奇病毒A16(CVA16)荧光定量聚合酶链式反应(PCR)检测后仍然不能确定型别的肠道通用型病毒阳性样本作为研究对象,参考美国NCBI基因库,设计特异性引物进行VP1区(395bp)序列扩增分析后进行双向测序.将成功测序的基因片段序列进行VP1区基因片段聚类分析.结果 孝感地区临床疑似病例中,3年内手足口病发病患者0～5岁病例数分别占总疑似病例数的97.74％、97.23％和97.05％;≤5岁儿童中,3年内男女比例分别为1.77:1、1.87:1和1.60:1.基于VP1区片段聚类分析,结果显示3年内本地区CVA6型和CVA5型病毒与中国地区参考序列明显聚为一类.结论 2014—2016年孝感地区手足口病EV17型为主要病原体,CVA16型次之.该次实验首次发现本地区CVA5型和CVA6型病原体.
