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蛋白激酶Cξ亚型基因及UrotensinⅡ基因中各有一个单核苷酸位点与中国北方汉族人群2型糖尿病相关
目的采用单核苷酸多态性(single nucletide polymorphism,SNP)标记,在以往中国北方汉族人群2型糖尿病相关基因定位区域(1p36.33-p36.23)内寻找疾病易感基因位点.方法通过生物信息学方法在公共SNP数据库中查找定位区域内10个候选基因中的23个SNP位点,用单碱基延伸反应(single base etension,SBE)法对北方汉族人群散发2型糖尿病患者(192例)及对照组(172例)进行分型及病例-对照关联分析.结果23个SNP位点中有8个为中国北方人群常见SNP位点;对病例组和对照组分型分析显示,位于蛋白激酶Cξ亚型(PRKCZ)基因中的一个位点(rs436045)及urotensinⅡ(UTS2)基因中的一个位点(rs228648),其等位基因频率在两组的差异具有统计学意义(P<0.05).结论上述两个SNP位点可能和中国北方汉族人群2型糖尿病相关,以上结果为进一步研究上述两个位点所在的基因与2型糖尿病的关系提供了理论依据.
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蛋白激酶Cξ亚型基因内SNP的连锁不平衡分析
目的对中国北方汉族人群2型糖尿病候选易感基因蛋白激酶Cξ亚型(PRKCZ)内的单核苷酸多态性(single Rucleotide po1ymorphism,SNP)标记进行群体相关分析及连锁不平衡(linkage disequilibrium,LD)分析,寻找疾病相关单体型.方法通过生物信息学方法在公共SNP数据库中查找PRKCZ基因中的SNP位点,用单碱基延伸反应(single base extension,SBE)法对北方汉族散发2型糖尿病患者173例及对照组152例进行分型及病例-对照关联分析和LD分析,构建SNP单体型区段(haplotype block).结果PRKCZ基因中有多个SNP位点与疾病相关,它们在病例组和对照组构成不同的haplotype block结构.由5个SNP位点组成的单体型频率在两组人群间存在显著差异.结论PRKCZ基因内由5个SNP位点组成的单体型可能和中国北方汉族人2型糖尿病相关,进一小从统计学角度证实了PRKCZ基因为该人群疾病易感基因.
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中国汉族人群近日钟基因与高脂血症的关联
目的 针对中国汉族人群,开展Clock、Clif节律基因多态性与高脂血症间关联研究,以进一步探讨近日节律对高脂血症的影响与作用,为基于易感基因的靶向药物治疗提供新思路.方法 采用病例-对照关联分析(casecontrol association study),以明确诊断的205例高脂血症患者和281例健康对照者为研究对象,研究节律基因相关的基因位点与高脂血症易感性、疾病严重程度等临床表型之间的关系并阐明其机制.根据选取的节律基因位点Clock(rs3840267,rs3749474,rs10529257)和Clif(rs2289709),确定相关位点的基因型,采用遗传统计学分析确定基因型与临床表型之间的关联性.结果 通过Clock、Clif基因多态性与高脂血症的病例-对照分析,发现Clock rs 10529257等位基因显著增加了高脂血症的患病风险(8.51％ vs 13.95％,Paalleo=0.003,ORalle.=0.529,95％CI=0.346,0.809);Clockrs3840267、rs3749474和Clifrs2289709在病例组和对照组中无显著差异(P＞0.05).通过高脂血症分型后病例-对照分析,发现Clock rs 10529257在Ⅳ型高脂蛋白血症亚型病例组和对照组之间有显著差异(9.72％vs 13.95％,Palleo-Ⅳ=0.043,ORalleoⅣ =0.525,95％CI=0.278,0.991);Clif rs2289709在Ⅱb型高脂蛋白血症亚型病例组和对照组之间亦有显著差异(19.23％vs8.72％,Palleo-Ⅱb=4.738×10-4,ORalleo-Ⅱb=2.959,95％CI=1.645,5.322).通过病例组中总胆固醇、甘油三酯、低密度脂蛋白胆固醇水平与两个阳性位点Clock rs 10529257、Clif rs2289709不同基因型比较发现,Clock rs10529257中-/A杂合子携带者与A/A纯合子基因型携带者的甘油三酯水平存在显著差异[(1.27±0.69) vs(1.76±1.22),P=0.01];Clif rs2289709中A/G杂合子携带者与G/G纯合子基因型携带者的甘油三酯、低密度脂蛋白分别存在显著差异[(2.31±1.81) vs (1.11±0.32),P=2.33×10-8;(2.83±0.98) vs (1.63±0.69),P=5.83×10-15).结论 本研究结果发现,节律基因Clock、Clif可能为中国汉族人群高脂血症疾病的相关基因.
