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小疏水蛋白(SH)基因文献资料
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唐山市流行性腮腺炎病毒小疏水蛋白基因序列分析
目的探讨唐山市流行性腮腺炎病毒的分子特征.方法收集唐山市不同行政区的流行性腮腺炎患儿唾液标本5份,其中,爆发病例2例,散发病例3例.经RT-PCR扩增小疏水蛋白(SH)基因并测序,利用Clustal X软件进行系统发育分析.结果唐山市分离的5株流行性腮腺炎病毒均为F亚型.各株病毒SH基因的核苷酸序列一致率为94.8%~100.0%,氨基酸序列一致率为91.4%~100.0%,但与国内主要野毒株SH基因的氨基酸序列一致率只有80.7%.系统发育分析显示,唐山市的各样本之间同源性较高,其次是国内的野毒株,而与国外野毒株及疫苗株同源性低.结论唐山市存在多种流行性腮腺炎病毒株流行,主要基因型为F亚型.