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固有免疫信号分子hsa-miR-181a调节脑卒中作用的生物信息学分析

吕燕妮;钱贻崧;付龙生;魏筱华

摘要: 对固有免疫信号分子hsa-miR-181a进行生物信息学分析,以期探讨其调节脑卒中的生物学途径和信号通路,为hsamiR-181a的实验验证及功能研究提供理论指导.利用TargetScan 6.0、miRWalk、miRanda、PicTar、Genecards数据库预测所得的hsa-miR-181a与脑卒中所相关的靶基因,通过BINGO及DAVID对脑卒中相关靶基因集合进行基因本体(gene ontology,GO)和信号通路分析.hsa-miR-181a可与固有免疫基因TLR4相互作用,并同时作用于与脑卒中相关的其它靶基因,通过调节细胞途径,影响代谢过程等生物学途径,神经营养因子信号转导等KEGG信号通路发挥作用.固有免疫信号分子hsa-miR 181a可通过调节细胞途径,影响代谢过程等生物学途径,神经营养因子信号转导等信号通路调节脑卒中,为进一步实验和功能验证提供生物信息学指导.

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    为研究强直性脊柱炎(ankylosing spondylitis,AS)患者PBMC组蛋白乙酰化水平,探究其在AS发病中的作用,收集32例AS稳定组患者、26例AS活动组患者和25例正常对照者的静脉血,采用H3/H4乙酰化检测试剂盒检测PBMC组蛋白H3、H4乙酰化水平,RT-PCR检测AS患者PBMC组蛋白乙酰基转移酶(histone acetyltransferase,HAT)和去乙酰基转移酶(histone deacetylase,HDAC)基因的mRNA表达水平.与正常对照组比较,AS活动组和AS稳定组患者PBMC组蛋白H3、H4均呈低乙酰化水平(P<0.05);AS活动组和AS稳定组患者PBMC的P300、CREBBP和HDAC2mRNA表达水平均明显降低(P<0.05).AS患者PBMC组蛋白H3、H4乙酰化水平与AS疾病活动度指数(ASDAS)呈正相关(P<0.05).AS患者PBMC组蛋白乙酰化异常,且与AS的发生、发展有一定相关性.

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