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不同培养基对SELDI-TOF MS细菌蛋白指纹图谱的影响
目的 检测不同培养基对细菌蛋白SELDI-TOF MS指纹图谱的影响.方法 3株参考菌株分别接种在不同培养基中,利用SELDI-TOF MS检测蛋白指纹图谱,分析其异同.结果 在所有培养基中参考菌株ATCC 12600、ATCC 25922和ATCC 27853蛋白质谱图恒定表达的蛋白峰个数为11、11、9个,同时菌株在不同培养基中也表达少量其独特的蛋白峰.结论 比较不同培养基上生长的同株菌蛋白指纹图谱,显示在不同培养基其细菌特征蛋白恒定表达.
关键词： 细菌 培养基 SELDI-TOF MS -
临床常见葡萄球菌蛋白指纹图谱的建立
目的 建立临床常见三种葡萄球菌的蛋白指纹图谱,为其快速诊断奠定基础.方法 收集临床常见葡萄球菌包括金黄色葡萄球菌、表皮葡萄球菌及溶血性葡萄球菌,利用16S rDNA测序技术对其进行鉴定；表面增强激光解吸电离飞行时间质谱(SELDI-TOF MS)技术检测其蛋白表达,采用Ciphergen Protein chip软件自动采集数据.评价该检测方法的重复性及细菌蛋白表达的稳定性.结果 在分子量3000 ～20000 Da范围内,3种葡萄球菌有各自特异的蛋白指纹图谱；SELDI-TOF MS检测细菌蛋白的孔间重复性和芯片间重复性好,同一株细菌4次重复的蛋白指纹图谱相似；同种细菌不同株之间蛋白指纹图谱表达稳定,共有蛋白峰分子量变异系数≤0.5％.结论 在分子量3000 ～20000 Da范围内,各细菌蛋白指纹图谱差异明显,为细菌的快速鉴定提供了新方法.
关键词： 革兰阳性球菌 蛋白指纹图谱 SELDI-TOF MS -
SELDI-TOF MS技术及其在传染性疾病研究中的应用
SELDI-TOF MS(surface-enhanced laser desorption ionization time-of-flight mass spectrometry,表面增强激光解吸离子化飞行时间质谱)技术,是随着蛋白质组学的兴起而出现的新技术,是一种基于蛋白质芯片和质谱技术的蛋白质指纹图谱分析平台.本文就SELDI-TOF MS技术的原理、特点及其在传染性疾病研究中的应用进行综述.
关键词： 传染性疾病 蛋白质组学 SELDI-TOF MS 蛋白质芯片 质谱 -
蛋白质芯片质谱仪在肿瘤标志物研究中的应用
表面加强激光解析电离飞行时间质谱(SELDI-TOF MS)是一种新的蛋白质检测技术.与传统的蛋白质组学方法相比,该技术具有快速、灵敏、高通量等特点.利用该技术制成的蛋白质芯片质谱仪已成为蛋白质组学研究中的重要工具.现综述该技术在肿瘤标志物研究中的应用.
关键词： 肿瘤标志物 SELDI-TOF MS 蛋白质芯片 -
蛋白质芯片质谱仪及其在肿瘤研究中的应用
表面加强激光解析电离飞行时间质谱仪(SELDI-TOF MS)是一种新的蛋白质检测技术,与传统的蛋白质组学方法相比,该技术具有快速、灵敏、高通量等特点.运用该技术制成的蛋白质芯片质谱仪已成为蛋白质组学研究中的重要工具.本文简要介绍了该技术及其在恶性肿瘤诊断、治疗及预后等方面的应用.
关键词： 蛋白质芯片 SELDI-TOF MS 质谱仪 肿瘤 基因表达 -
不同疗效的非霍奇金淋巴瘤血清蛋白质质谱分析
目的 分析正常组、非霍奇金淋巴瘤(NHL)化疗6周期后完全缓解(CR)及NHL化疗6周期后未完全缓解或缓解后3月内复发患者的血清差异表达蛋白质,为筛选和建立NHL临床疗效监测及预后评估的血清学指标提供理论依据.方法 采用表面增强激光解析离子化飞行时间质谱(SELDI-TOFMS)技术,应用铜离子结合芯片(IMAC-Cu)以及配套软件,对35例正常组,35例NHL化疗6周期后CR患者组,35例NHL化疗6周期后未完全缓解或缓解后3月内复发患者组的血清差异表达蛋白质进行检测分析,构建决策树分类模型.结果 (1)正常组和NHL化疗6周期后CR患者组共有6种差异表达蛋白质有分类意义,质荷比分别为M8 778.14u、M8 887.83 u、M8 529.39u、M9 076.76 u、M9 242.75 u、M5 848.92 u,M/Z为M5 848.2u的一种蛋白质被软件系统选取建立决策树分类模型,灵敏度和特异性分别为88.57%和100%;(2)正常组和NHL化疗6周期后未CR或缓解后3月内复发患者组共有6种差异表达蛋白质有分类意义,质荷比分别为M8 890.26 u、M5 853.70u、M5 444.38 u、M8 784.58 u、M6 354.26 u、M8 539.28 u,其中M/Z为M5 444.38 u的一种蛋白质被软件系统选取建立决策树分类模型,灵敏度和特异性分别为85.71%和100%;(3)NHL化疗6周期后CR患者和NHL化疗6周期后未CR或缓解后3月内复发患者组共有6种差异表达蛋白质有分类意义,质荷比分别为M6 436.04 u、M5 509.43 u、M6 633.93 u、M14 047.6 u、M7 769.91 u、M6 009.63 u,其中M/Z为M6 436.04u的一种蛋白质被软件系统选取建立决策树分类模型,灵敏度和特异性分别为77.14%和100%.结论 有分类意义的18种差异表达蛋白质有可能成为NHL临床疗效监测及指导临床治疗的一组分子学指标.
关键词： 非霍奇金淋巴瘤 SELDI-TOF MS 蛋白质组学 差异表达蛋白质 -
早期肝纤维化外周血清标志物筛选的初步研究
目的 探讨早期病毒性乙型肝炎(乙肝)肝纤维化的潜在血清标志物并建立相应的诊断模型.方法 采用表面增强激光解吸/离子化时间飞行质谱(SELDI-TOF-MS)技术检测20个健康人和31例早期乙肝肝纤维化患者的血清蛋白质谱,用biomarker Wizard软件筛选出早期肝纤维化的差异表达蛋白质谱峰,用Biomarker Pattern软件对差异蛋白峰值进行线性分析并建立诊断模型.结果 在分子量为2000～20000Da的区间内检测出97个峰值,15个为差异蛋白峰,其中早期肝纤维化患者有3个上调,12个下调.用质荷比为M4799和M6125的差异蛋白联合建立的诊断模型优,其特异度为80%(16/20),灵敏度为87%(27/31).结论 SELDI-TOF-MS在筛选早期肝纤维化血清学标志物方面具有较高的灵敏度和特异性,作为肝纤维化早期筛选的方法尚需大宗病例证实及临床后续验证.
关键词： 乙型肝炎 肝纤维化 血清标志物 SELDI-TOF MS -
心肌缺血早期表达蛋白的质谱研究
目的 用SELDI-TOF MS观察大鼠急性心肌缺血后心肌蛋白质谱的变化规律,筛选心肌缺血的蛋白标记物,为法医学心源性猝死的诊断提供依据.方法 SD大鼠分成手术组,假手术组和非手术对照组.在结扎大鼠冠脉前降支后5 min～6 h内不同的时间段取大鼠心肌组织.蛋白提取后用CM10芯片结合SELDI-TOF MS质谱仪检测.结果 血清CM10芯片检测到3个缺血后蛋白峰,质荷比(m/z)分别为6304Da、8337Da、8375Da,在手术组中阳性率和特异性均为100%,假手术组和非手术组中均没有发现.特异性升高的峰有3个:峰6658Da、6876Da,都是在实验组中≥15min以后升高2倍以上,8577Da峰则在缺血≥5min组升高.结论 大鼠心肌组织中6304Da、8337Da、8375Da蛋白峰都是急性心肌缺血后的较为特异性改变,可在心肌缺血后5min内出现,有可能做为心肌缺血的蛋白标记,亦可能用于心肌缺血和法医学心源性猝死的诊断.
关键词： 法医病理学 SELDI-TOF MS 心肌缺血 猝死
