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癌基因组图谱文献资料
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GEO公共数据集分析载脂蛋白D在胃癌中表达及临床意义
目的 通过基因表达汇编(GEO)公共数据集研究载脂蛋白D(ApoD)在不同分期及不同类型胃癌患者中的表达情况,探讨ApoD与胃癌发生及发展的关系,为临床诊疗及风险预测提供依据.方法 从美国国家生物技术信息中心(NCBI)的GEO数据库(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo)中下载基因表达谱公共数据集GSE62254,纳入标准为包含ApoD表达数据的胃癌肿瘤表达谱.探究ApoD表达与胃癌临床病理学参数之间的相关性及其对预后的影响.采用基因集富集分析(GSEA)法预测ApoD的调控基因.结果 ApoD在女性、年龄≤60岁及弥漫型胃癌的患者中高表达,同时其表达与胃癌的T分期、临床分期呈正相关.在预后方面,ApoD高表达的胃癌患者无进展存活时间、总存活期明显短于低表达患者(P＜0.05).ApoD高表达样本富集了细胞黏附、紧密连接、花生四烯酸代谢等基因集.结论 在胃癌中,ApoD高表达为预后不良因素,可作为影响胃癌患者预后的判断因素.
