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氨基糖苷类抗生素生物合成基因研究进展
目的对氨基糖苷类抗生素生物合成基因的研究进展作一综述.方法按照化学结构类型,分别介绍了有糖苷取代的氨基环己醇类抗生素和2-脱氧链霉胺类抗生素的生物合成基因的研究状况,以及氨基糖苷类抗生素生物合成基因的特点.结果与结论氨基糖苷类抗生素生物合成基因具有很多共同的特点,为进一步对氨基糖苷类抗生素生物合成基因进行克隆、研究及基因改造提供了参考.
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雷帕霉素生物合成基因簇的研究进展
雷帕霉素有效的免疫抑制作用备受关注,尤其是雷帕霉素产生菌吸水链霉菌的雷帕霉素生物合成基因簇的测定,雷帕霉素的生物合成途径得到全面系统的研究.本文从雷帕霉素基因簇出发,重点综述雷帕霉素生物合成代谢的研究进展.
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非核糖体含硫多肽类抗生素生物合成基因的研究进展
1 前言非核糖体含硫多肽类(non-ribosomal thiopeptide)抗生素是多肽类抗生素中的一个重要家族,包括硫链菌丝肽(Thiostrepton)、那西肽(Nosihepted)、短杆菌肽 S(Gramicidin S)和环孢霉素(Cyclosporine)等.
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黑暗链霉菌安普霉素生物合成基因aprG的克隆和功能研究
从安普霉素产生菌S.tenebrarius H6总DNA中已克隆得到8.2kb的安普霉素抗性基因连锁片段.对距离抗性基因下游4.5kb的SacI-Sau3AI片段进行测序分析,发现了一个新的891bp开放阅读框架.推测其编码为296个氨基酸的蛋白质.经BLASTX程序分析,没有发现与之同源的基因,是一个新基因,该基因命名为aprG.构建基因阻断穿梭载体pSPU58,经接合转移导入S.tenebrariusH6,筛选单交换阻断变株,并用Southern blot验证阻断变株的aprG已经被破坏.经发酵分析,阻断变株不再合成安普霉素,表明aprG与安普霉素生物合成直接相关.
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Geldanamycin产生菌生物合成相关基因的克隆与分析
目的从geldanamycin产生菌吸水链霉菌(S.hygroscopicus)中克隆生物合成基因,为阐明生物合成机制及改造其结构奠定基础.方法以链霉菌/大肠埃希氏菌穿梭cosmids pKC505为载体构建了插入片段为20～30kb的S.hygroscopicus总DNA文库.以利福霉素中与3-氨基-5-羟基苯甲酸(AHBA)合成相关基因为探针,经菌落杂交,Southern杂交筛选同源基因片段.测序结果与Genbank进行同源性比较分析,并以attp-噬菌体载体KC515利用基因阻断实验对克隆的基因片段进行功能鉴定.结果构建的基因文库含重组基因比率高、基因组覆盖率高,稳定性好.经同源基因探针杂交,从文库中筛选出9个阳性cosmids克隆pCGB20、pCGB26、pCGB28、pCGB29、pCGB36、pCGB45、pCGB49、pCGB63、pCGB75.测序分析表明,cosmidpCGB20中BamHI-BamHI 8kb片段两端的不完整ORF编码蛋白与竹桃霉素(oleandomycin)PKS Module 5、Module 6(一致性为79%)和红霉内酯合成酶ORF2(一致性为75%)、ORF1(一致性为73%)、ORF3(一致性为70%)高度同源;BamHI-BamHI 3kb片段一端与编码类结核分枝杆菌的磷酸吡哆醛依赖的氨基转移酶家族中半胱氨酸脱硫酶的DNA有同源性,该家族与AHBA合成酶关系密切.Cosmid pCGB20的BamHI-BamHI 8kb及BamHI-BamHI 3kb基因片段已通过基因阻断实验初步鉴定,证明它们参与geldanamycin生物合成.而其他cosmids阳性克隆的序列分析及功能研究尚在进行中.
关键词： geldanamycin 生物合成基因 基因文库 基因阻断 -
2-脱氧链霉胺类抗生素生物合成基因的研究进展
含2-脱氧链霉胺类(2-DOS)氨基糖苷抗生素是临床常用抗生素.近几年对2-脱氧链霉胺类抗生素的分子水平研究取得重大进展,得到了2-DOS合成中的关键酶基因,以及丁酰苷菌素、妥布霉素、卡那霉素、庆大霉素等部分生物合成基因簇克隆.本文对2-脱氧链霉胺类抗生素生物合成基因研究进展进行了综述.
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微生物卤代酶研究进展
迄今为止,已经发现了近3800种卤化物,其中很多是重要的抗生素.对这些抗生素的卤化机制的研究发现了四类负责生物卤化的卤代酶.本文综述了这四类卤代酶的特点,并介绍利用卤代酶基因为探针发现海洋放线菌中新抗生素生物合成基因簇的研究进展.
