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Sj-TSP2文献资料
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日本血吸虫被膜蛋白Sj-TSP2基因序列多态性分析
目的 分析日本血吸虫Sj-TSP2序列多态性.方法 抽提单条日本血吸虫成虫的总RNA,逆转录合成cDNA,PCR扩增目的片段.将目的片段克隆到载体pBlue2KSM中转化大肠杆菌,挑取10个阳性克隆测序.将获得的Sj-TSP2序列导入DnaSP序列分析软件进行分析,计算等位基因数目,鉴定单核苷酸多态性位点(single nuclear polymorphism,SNP).同时将序列导入Mega 4序列分析软件,计算错义突变率与同义突变率的比值(dN/dS),进行进化分析,构建进化树.结果 共抽提了60条日本血吸虫成虫的总RNA,其中46条通过RT-PCR获得了目的基因Sj-TSP2；序列分析共鉴定了20个等位基因,主要是由点突变引起,Sj-P2-10是优势等位基因.共鉴定了85个SNP位点,对应于63个密码子的变异,其中36个是同义突变,27个是错义突变,有22个错义突变发生在膜外大环结构域中.结论 Sj-TSP2基因高度变异,大多数突变存在膜外大环区,共鉴定了20个Sj-TSP2等位基因.
