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靶向人 BRG1基因的慢病毒载体构建及效率验证
目的：构建靶向人 BRG1基因的短发夹 RNA（shRNA）慢病毒载体并验证其沉默效率。方法：设计3个针对人 BRG1基因的特异性 shRNA 序列（shBRG1），构建于 pLKO．1慢病毒载体中，并与 psPAX2和 pMD2．G 质粒共同转染293T 细胞以包装成慢病毒颗粒。将包装好的慢病毒感染人主动脉平滑肌细胞（HASMC），应用实时荧光定量 PCR 和 western blot 检测 BRG1 mRNA 和蛋白表达水平，判断其沉默效率。结果：3种 shBRG1干扰序列均成功插入慢病毒载体中且测序正确，3种慢病毒均可有效降低 BRG1 mRNA 表达水平（P 均＜0．01）。其中 shBRG1-3的沉默效率高，其感染HASMC 后 BRG1蛋白表达水平较对照组显著下降（P ＜0．01）。结论：靶向人 BRG1基因的 shRNA 慢病毒表达载体构建成功，shBRG1-3慢病毒能够有效降低 BRG1 mRNA和蛋白表达水平。
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乙酰化酶基因 RNA 干扰文库的构建及其对 HepG2．2．15细胞的感染
目的：构建人类基因组中16个组蛋白乙酰化酶的短发夹 RNA（shRNA）慢病毒载体文库，为进一步探索表观遗传学基因在 HBV 调控中的作用机制提供有利工具。方法根据 shRNA 引物设计原则，针对每个基因选择8对确保干扰效率的 shRNA 序列（A～H），将引物退火后连接至 shRNA空慢病毒载体上转化，PCR 法验证菌落克隆，确认阳性克隆；对质量合格的质粒再进行单切酶验证。分别将同一基因的4个 shRNA 慢病毒质粒混合，分别包装病毒。293T 细胞转染48 h 和72 h 后收集病毒粗液，感染 HepG2．2．15细胞。感染72 h 后用荧光显微镜观察并评估荧光细胞比例。结果针对16个乙酰化酶基因，构建128个慢病毒载体 RNA 干扰（RNAi）文库，72 h 后慢病毒感染 HepG2．2．15细胞的效率＞80％。结论成功构建16个组蛋白乙酰化酶的 shRNA 慢病毒载体，从而为研究人组蛋白乙酰化酶对 HBV 复制的影响奠定了坚实的基础。
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靶向沉默巨噬细胞中 Mcl-1基因 shRNA表达质粒的构建与鉴定
目的：研究髓样细胞白血病-1(myeloid cell leukemia-1,Mcl-1)基因在小鼠巨噬细胞 Raw264.7和人巨噬细胞THP-1中的表达情况,筛选出表达含量高的细胞株作为实验用细胞,根据筛选的结果构建靶向小鼠 Mcl-1基因的短发夹 RNA(shRNA)真核表达质粒进行转染,后筛选出沉默 Mcl-1基因效果明显的 shRNA 表达质粒。方法利用半定量 RT-PCR 和蛋白质免疫印迹(Western blotting)分别检测两种巨噬细胞中 Mcl-1mRNA 和蛋白表达情况。采用小分子干扰 RNA(siRNA)软件设计3个针对 Mcl-1基因不同位点的 shRNA 片段,由公司构建携带此 shRNA 片段的真核表达质粒(Mcl-1 shRNA1-3),然后通过脂质体将真核表达质粒载体转染到小鼠巨噬细胞株 Raw264.7中,24、48 h 后通过倒置荧光显微镜观察转染效果,并分别采用实时定量 PCR 和 Western blot 检测 Mcl-1 mRNA 和蛋白表达情况。结果小鼠巨噬细胞 Raw264.7中 Mcl-1的 mRNA 及蛋白质的表达显著高于人巨噬细胞,差异有统计学意义(P <0.05)；构建的 shRNA 表达载体在24、48 h 均能降低 Raw264.7细胞内 mcl-1 mRNA 和蛋白水平,尤其在48 h 沉默效果为明显；转染48 h 后与正常组、脂质体组和阴性对照组相比,差异有统计学意义(P <0.05)；与 Mcl-1 shR-NA1和 Mcl-1 shRNA2相比,Mcl-1 shRNA3对 Mcl-1 mRNA 和蛋白的沉默作用强。结论成功筛选出了实验所用细胞 Raw264.7及对小鼠巨噬细胞 Raw264.7内 Mcl-1具有明显沉默效果的靶向 Mcl-1 shRNA3真核表达质粒。
