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实时逆转录多聚酶链反应文献资料
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实时荧光定量RT-PCR和寡核苷酸芯片方法分析食管腺癌组织中基因的表达
目的 采用实时荧光定量RT-PCR和寡核苷酸芯片技术分析食管腺癌基因表达的特征.方法 应用寡核苷酸芯片筛选6例食管腺癌基因表达谱,实时荧光定量RT-PCR验证其中8个基因的表达变化.结果 2倍差异表达基因(DEGs)中,上调基因共212个,下调基因共126个;涉及细胞周期相关基因、信号转导相关基因、血管生成相关基因、细胞增殖相关基因、凋亡抑制基因、抑癌基因、黏附和代谢等.实时荧光定量RT-PCR和寡核苷酸芯片技术对8个基因的检测结果一致,不仅变化方向相同,而且表达值非常接近.结论 食管腺癌的发生、发展涉及多基因多步骤,是一个复杂的过程.寡核苷酸芯片和实时荧光定量RT-PER分析基因表达变化都是可信的,基因芯片筛选基因表达谱具有高通量大规模的特点,而实时荧光定量RT-PCR则适合单个基因表达变化的研究,两者互为补充和印证.
关键词： 食管腺癌 寡核苷酸芯片 基因表达谱 实时逆转录多聚酶链反应 -
实时荧光定量RT-PCR和cDNA基因芯片方法分析食管癌组织中基因的表达
目的:采用实时荧光定量RT-PCR和cDNA基因芯片2种技术分析食管癌细胞基因表达的特征.方法:应用cDNA基因芯片筛选15例食管癌基因表达谱,用实时荧光定量RT-PCR验证其中16个基因的表达变化.结果:实时荧光定量RT-PCR和cDNA基因芯片技术对16个基因的检测结果一致,不仅变化方向相同,而且表达值非常接近.结论:cDNA基因芯片和实时荧光定量RT-PCR分析基因表达变化都是可信的,基因芯片筛选基因表达谱具有高通量大规模的特点,而实时荧光定量RT-PCR则适合单个基因表达变化的研究,两者互为补充和印证.
关键词： 食管癌 基因芯片 基因表达谱 实时逆转录多聚酶链反应
