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HLA-DPA1和-DPB1基因第2、第3外显子同步测序分型的研究
目的:建立可靠的HLA-DPA1和-DPB1基因第2、第3外显子同步测序分型的方法.方法:采用一对位点特异性引物扩增HLA-DPA1基因的第2外显子、第2内含子、第3外显子及其两翼的部分内含子序列,采用2对位点特异性引物扩增HLA-DPB1目的基因片段:第1对引物扩增HLA-DPB1基因第2外显子及两翼的部分内含子序列,第2对引物扩增HLA-DPB1基因第3外显子及两翼的部分内含子序列.PCR产物经核酸外切酶和碱性磷酸酶纯化,用本文的测序引物分别对HLA-DPA1和-DPB1第2、第3外显子进行双向测序.纯化的测序反应产物,经ABI 3730测序仪电泳,用Assign 4.7.1分析软件判定基因型.结果:HLA-DPA1及-DPB1基因的PCR扩增获得了清晰的目的条带,对其第2、第3外显子进行测序,所获的序列中无背景杂峰.用本文的方法对随机的96人份造血干细胞志愿捐献者标本进行HLA-DPB1测序分型,与采用SeCoreTM DPB1商品化测序分型试剂盒平行对照检测的结果相一致.结论:本文的方法在群体遗传学及疾病关联研究等领域具有广泛的使用价值.
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HLA-A、-B、-C、-DRB1和-DQB1等位基因全相合的无关供-受者对的HLA-DPA1和-DPB1基因匹配性研究
目的 研究HLA-A、-B、-C、-DRB1和-DQB1等位基因全相合的无关供-受者对HLA-DPA1和-DPB1基因的匹配性.方法 对76对HLA-A、-B、-C、-DRB1和-DQB1等位基因10/10相合的无关供-受者样本进行HLA-DPA1和-DPB1基因测序分型,从等位基因水平统计和分析HLA-DPA1和-DPB1基因匹配的比例和特点.结果 单个HLA-DPA1、-DPB1基因高分辨水平完全相合的比例分别为17.1％、9.2％,完全相合的比例均较低.HLA-DPA1等位基因半相合的比例占绝大多数(73.7％),完全不合的比例为9.2％;具有高度多态性的HLA-DPB1基因半相合的比例为57.9％,而完全不合的比例为32.9％.统计HLA-DPA1+-DPB1等位基因的匹配率,2/4相合的比例高(51.4％),4/4相合的比例仅为5.6％,而0/4相合的比例为8.3％.结论 HLA-A、-B、-C、-DRB1和-DQB1等位基因相合的无关供-受者对HLA-DPA1和-DPB1基因匹配率尚较低,HLA-DPA1和-DPB1基因匹配程度对无关供者造血干细胞移植的影响应引起临床的重视和探讨.
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云南汉族多形性日光疹与HLA-DPA1、DPB1和DRB1的多态性分析
目的 研究云南汉族多形性日光疹(PLE)患者的HLA-DPA1、DPB1和DRB1等位基因和单倍型的多态性,探讨多形性日光疹的发病机制.方法 采用PCR-SBT法检测云南汉族PLE患者和健康人群HLA-DPA1、DPB1和DRB1基因分布,比较两组间等位基因和单倍型频率,分析其与PLE发病的相关性.结果 HLA-DPA1*02∶02∶03、DPB1 *05∶01∶01、DPB1*14∶01∶01,DRB1*08∶03∶02等位基因和DPA1*02∶02∶03-DPB1*05∶01∶01单倍型在病例组中频率明显升高,HLA-DPA1*02∶01∶02,DPA1*02∶02∶02、DRB1*03∶01∶01、DRB1*11∶01∶01、DRB1*12∶02∶01等位基因和DPA1*02∶02∶02-DRB1*03∶01∶01单倍型在病例组中频率明显降低,未发现有统计学意义的三位点单倍型.结论 HLA-DPA1、DPB1和DRB1与云南汉族多形性日光疹发病具有相关性.
